当前蛋白身份：V9HW68
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6MHG Cryo-EM structure of the circumsporozoite protein of Plasmodium falciparum with a vaccine-elicited antibody reveals maturation of inter-antibody contacts 提交 2018-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 A
130–244（115 aa）
链 B
130–244（115 aa）
链 C
130–244（115 aa）
链 D
130–244（115 aa）
链 F
130–244（115 aa）
链 G
130–244（115 aa）
链 H
130–244（115 aa）
链 I
130–244（115 aa）
链 J
130–244（115 aa）
链 K
130–244（115 aa）
链 M
130–244（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 6MXR Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98M,HC-G99M] 提交 2018-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
130–246（117 aa）
链 H
130–246（117 aa）
|
突变：Y33W, D98M, G99M 突变：Y33W, D98M, G99M | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5.6；295 K；0.1 M tris-sodium citrate, pH 5.6, 11% PEG4000, 8% isopropanol
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.200 |
| 6MXS Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98F,HC-G99M] 提交 2018-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
130–246（117 aa）
链 H
130–246（117 aa）
|
突变：Y33W,D98F,G99M 突变：Y33W,D98F,G99M | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5.6；295 K；0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.6, 12% PEG4000, 10% isopropanol
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 6MY4 Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98M,HC-G99M,LC-S30bR] 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
130–246（117 aa）
链 H
130–246（117 aa）
|
突变：Y33W,D98M,G99M 突变：Y33W,D98M,G99M | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；295 K；0.05 M imidazole, pH 8.0, 18% PEG6000
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.230 |
| 6MY5 Crystal structure of the dimeric bH1-Fab variant [HC-Y33W,HC-D98F,HC-G99M,LC-S30bR] 提交 2018-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
130–246（117 aa）
链 H
130–246（117 aa）
|
突变：Y33W,D98F,G99M 突变：Y33W,D98F,G99M | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；295 K；0.04 M imidazole, pH 8.0, 21% PEG6000
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.229 |
| 6U1N GPCR-Beta arrestin structure in lipid bilayer 提交 2019-08-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
130–247（118 aa）
|
未记录 | 2CU 3-amino-5-chloro-N-cyclopropyl-4-methyl-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]thieno[2,3-b]pyridine-2-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7CZW S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2G7 提交 2020-09-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
127–470（344 aa）
链 J
127–470（344 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7CZY S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2F11_2B 提交 2020-09-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
127–470（344 aa）
链 J
127–470（344 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7CZZ S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2F11_3B 提交 2020-09-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 H
127–470（344 aa）
链 I
127–470（344 aa）
链 J
127–470（344 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7D03 S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with FabP5A-2G7 提交 2020-09-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
126–470（345 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |