SAXSdb — 11sz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

Amycolatopsis mediterranei

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	1B2 Antibody Fragment (Fab) Heavy Chain × 2 1B2 Antibody Fragment (Fab) Light Chain × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O54666_AMYMD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 32–995； UniProt 2194–3157 作者链 B； PDB构建体 32–995； UniProt 2194–3157

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

Amycolatopsis mediterranei

UniProt Q03132

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	1B2 Antibody Fragment (Fab) Heavy Chain × 2 1B2 Antibody Fragment (Fab) Light Chain × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ERYA2_SACER
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 996–1074； UniProt 3489–3567 作者链 B； PDB构建体 996–1074； UniProt 3489–3567

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	11sz
沉积日期 deposition_date	2026-03-11
结构标题 title	Antibody (1B2) Bound Rifamycin Synthetase Module 2
关键词 keywords	polyketide synthase, antibody, BIOSYNTHETIC PROTEIN-Immune System complex; BIOSYNTHETIC PROTEIN/Immune System
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

11sz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

11sz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

11sz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	50.25 Å
Rg（电子密度）	50.60 Å
总 Rg	50.62 Å
原子数	15743
残基数	2115
排除体积	277650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`11sz__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2
分子量 formula_weight	115872.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.94
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	15743

MASTDSEKVAEYLRRATLDLRAARQRIRELEEEPIAIVAMACRFPGGVHSPEDLWRLVADGADAVTEFPADRGWDTDRLYHEDPDHEGTTYVRHGAFLDDAAGFDAAFFGISPNEALAMDPQQRLLLETSWELFERAAIDPTTLAGQDIGVFAGVNSHDYSMRMHRAAGVEGFRLTGGSASVLSGRVAYHFGVEGPAVTVDTACSSSLVALHMAVQALQRGECSMALAGGVMVMGTVETFVEFSRQRGLAPDGRCKAFADGADGTGWSEGVGLLLVERLSEAQRRGHQVLAVVRGSAVNSDGASNGLTAPNGPSQQRVIRKALAAAGLSTSDVDAVEAHGTGTTLGDPIEAEALLATYGQNRETPLWLGSVKSNLGHTQAAAGVAGVIKMVMAMRHGVLPRTLHVDRPSSYVDWSAGAVELLTEARDWVSNGHPRRAGVSSFGIGGTNAHVVLEEVAAPITTPQPEPAEFLVPVLVSARTAAGLRGQAGRLAAFLGDRTDVRVPDAAYALATTRAQLDHRAVVLASDRAQLCADLAAFGSGVVTGTPVDGKLAVLFTGQGSQWAGMGRELAETFPVFRDAFEAACEAVDTHLRERPLREVVFDDSALLDQTMYTQGALFAVETALFRLFESWGVRPGLLAGHSIGELAAAHVSGVLDLADAGELVAARGRLMQALPAGGAMVAVQATEDEVAPLLDGTVCVAAVNGPDSVVLSGTEAAVLAVADELAGRGRKTRRLAVSHAFHSPLMEPMLDDFRAVAERLTYRAGSLPVVSTLTGELAALDSPDYWVGQVRNAVRFSDAVTALGAQGASTFLELGPGGALAAMALGTLGGPEQSCVATLRKNGAEVPDVLTALAELHVRGVGVDWTTVLDEPATAVGTVLPTYAFQHQRFWVDVDETAAVSVTPPPAEPIVDRPVQDVLELVRESAAVVLGHRDAGSFDLDRSFKDHGFDSLSAVKLRNRLRDFTGVELPSTLIFDYPNPAVLADHLRAELLGEFAASPAVDIGDRLDELEKALEALSAEDGHDDVGQRLESLLRRWNSRRADAPSTSAISEDASDDELFSMLDQRFGGGEDLGNSSSVDKLAAALEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Amycolatopsis mediterranei
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	33910
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	1B2 Antibody Fragment (Fab) Heavy Chain
分子量 formula_weight	26447.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H

MAEVQLVQSGGGLVQPGRSLRLSCTASGFTFGDYAMSWVRQAPGKGLEWVGFIRSKAYGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCTRGGTLFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCAALVPRGSAHHHHHHAADYKDDDDKA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	1B2 Antibody Fragment (Fab) Light Chain
分子量 formula_weight	25715.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,L

LFAIPLVVPFYSHSALDVVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSNGYNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQSLQTPRLTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPRGAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.940 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.94 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	852885

Antibody (1B2) Bound Rifamycin Synthetase Module 2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

11sz__assembly_1__model_1

11sz__assembly_1__model_1 | I(q)

11sz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Antibody (1B2) Bound Rifamycin Synthetase Module 2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

6-deoxyerythronolide-B synthase, Erythronolide synthase EryA2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

11sz__assembly_1__model_1

11sz__assembly_1__model_1 | I(q)

11sz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)