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1a34

SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS

Satellite Tobacco Mosaic Virus

UniProt P17574

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 60 RNA 120 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 60 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 60 SULFATE ION × 60 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 60 water × 180 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 1 SULFATE ION × 1 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致
3 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 5 RNA 10 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 5 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 5 SULFATE ION × 5 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 5 water × 15 与全部聚合物一致
4 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 6 RNA 12 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 6 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 6 SULFATE ION × 6 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 water × 18 与全部聚合物一致
5 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 2 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 1 SULFATE ION × 1 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 water × 3 与全部聚合物一致
6 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 15 RNA 30 ;RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3') ; × 15 ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3') ; × 15 SULFATE ION × 15 URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 15 water × 45 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
5bkq 7m3r 7m54

共 3 个 assembly

异源或核酸复合物
1a34 1a34 1a34 1a34 1a34 1a34 4nia 4oq8 4oq8 4oq8 4oq8 4oq8

共 24 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_STMV
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1a34
沉积日期 deposition_date1998-01-28
结构标题 titleSATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX
关键词 keywords;WATER STRUCTURE, RNA, VIRUS ASSEMBLY, MACROMOLECULAR INTERACTIONS, SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS, Icosahedral virus, Virus-RNA COMPLEX ;; Virus/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1a34__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1a34__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1a34__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）66.90 Å
Rg（电子密度）68.71 Å
总 Rg68.51 Å
原子数175440
残基数10020
排除体积1584700 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1a34__assembly_1__model_1 180-MERIC （180） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1a34__assembly_2__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1a34__assembly_3__model_1 pentadecameric （15） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1a34__assembly_4__model_1 octadecameric （18） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1a34__assembly_5__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 1a34__assembly_6__model_1 45-meric （45） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1a34a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.7 — Satellite viruses
家族 Family familyb.121.7.1 — Satellite viruses

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1a34A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220 — Satellite virus coat domain
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7. 引用文献 (5)