← 返回搜索
1a7l

DOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 124.1 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MALE-B363

synthetic construct

UniProt P02928

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 27–389 未记录 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000. 分辨率 2.90 Å R-free 0.286
2 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 27–389 未记录 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000. 分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 27–389 未记录 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000. 分辨率 2.90 Å R-free 0.286
4 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 27–389 链 B； UniProt 27–389 未记录 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.5；PROTEIN CONCENTRATION 3.0MG/ML, BUFFER 0.1M TRIS-HCL PH 8.5 WITH 0.2 M MGCL2, 1 MM MALTOSE, 26% PEG 4000. 分辨率 2.90 Å R-free 0.286

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1A7L Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ANF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTOSE 提交 1997-06-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2
分辨率 1.67 Å
1DMB REFINED 1.8 ANGSTROMS STRUCTURE REVEALS THE MECHANISM OF BINDING OF A CYCLIC SUGAR, BETA-CYCLODEXTRIN, TO THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1993-06-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1EZ9 STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P1 CRYSTAL FORM 提交 2000-05-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 3350, MES, sodium azide, maltotetraitol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
1EZ9 STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P1 CRYSTAL FORM 提交 2000-05-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 3350, MES, sodium azide, maltotetraitol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
1EZO GLOBAL FOLD OF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH BETA-CYCLODEXTRIN 提交 2000-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：I28T 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient
NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1EZP GLOBAL FOLD OF MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH BETA-CYCLODEXTRIN USING PEPTIDE ORIENTATIONS FROM DIPOLAR COUPLINGS 提交 2000-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：I28T 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient
NMR测量条件 pH 7.2；310 K；压力 ambient
NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.4 mM maltodextrin binding protein U-15N,13C,2H, with 1H amide and methyl on Val, Leu, and Ile(delta1) 2mM beta-cyclodextrin, 20 mM sodium phosphate pH 7.2, 3uM NaN3, 100uM EDTA. ~19mg/ml pf1 bacteriophage | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1FQA STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P2(1)CRYSTAL FORM 提交 2000-09-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；273 K；PEG 3350, NaN3, MES, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.215
1FQB STRUCTURE OF MALTOTRIOTOL BOUND TO OPEN-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN IN P2(1)CRYSTAL FORM 提交 2000-09-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；273 K；PEG 3350, NaN3, MES, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
1FQC CRYSTAL STRUCTURE OF MALTOTRIOTOL BOUND TO CLOSED-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 2000-09-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 6000, Mes, NaN3, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
1FQD CRYSTAL STRUCTURE OF MALTOTETRAITOL BOUND TO CLOSED-FORM MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 2000-09-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 6000, Mes, NaN3, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.244
1IUD MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN INSERTION/DELETION MUTANT WITH AN INSERTED B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS 提交 1996-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：INSERTED B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.281
1JVX Maltodextrin-binding protein variant D207C/A301GS/P316C cross-linked in crystal 提交 2001-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：D207C/A301GS/P316C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；PEG 6000, sodium MES, maltose, sodium azide, beta-mercaptoethanol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.304
1JVY Maltodextrin-binding protein variant D207C/A301GS/P316C with beta-mercaptoethanol mixed disulfides 提交 2001-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：D207C/A301GS/P316C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；PEG 6000, sodium MES, maltose, sodium azide, beta-mercaptoethanol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.273
1JW4 Structure of ligand-free maltodextrin-binding protein 提交 2001-09-02 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；298 K；PEG 20k, Mes, sodium azide, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.260
1JW5 Structure of Maltose Bound to Open-form Maltodextrin-binding Protein in P1 Crystal 提交 2001-09-02 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；PEG 20k, Mes, sodium azide, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
1LAX CRYSTAL STRUCTURE OF MALE31, A DEFECTIVE FOLDING MUTANT OF MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2002-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa） 片段：MALE31
突变：G32D I33P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG 4000, TRIS/HCl, ISOPROPANOL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.85 Å R-free 0.202
1LAX CRYSTAL STRUCTURE OF MALE31, A DEFECTIVE FOLDING MUTANT OF MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2002-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 27–396（370 aa） 片段：MALE31
突变：G32D I33P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG 4000, TRIS/HCl, ISOPROPANOL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 1.85 Å R-free 0.202
1LLS CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED MALTOSE BINDING PROTEIN WITH XENON 提交 2002-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 XE XENON × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；10 mM Sodium Citrate, 23% PEG 8000, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
1MDP REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 1 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1MDP REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 2 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1MDQ REFINED STRUCTURES OF TWO INSERTION(SLASH)DELETION MUTANTS PROBE FUNCTION OF THE MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN 提交 1994-08-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MG1 HTLV-1 GP21 ECTODOMAIN/MALTOSE-BINDING PROTEIN CHIMERA 提交 1999-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 31–387（357 aa） 片段：GP21 ECTODOMAIN (GP62 RESIDUES 338-425)
未记录 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.7；pH 4.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.305
1MH3 maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form I 提交 2002-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：E359A, K362A, D363A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；amonium sulfate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
1MH4 maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form II 提交 2002-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：E359A, K362A, D363A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 6000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.293
1MPB MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG) 提交 1995-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：W230R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1MPC MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG) 提交 1995-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：W230R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å
1MPD MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN (MALTOSE-BINDING PROTEIN) MUTANT, WITH ARGININE REPLACING TRYPTOPHAN AT POSITION 230 (TRP-230-ARG), COMPLEXED WITH MALTOSE 提交 1995-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：W230R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1N3W Engineered High-Affinity Maltose-Binding Protein 提交 2002-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：Deletion of residues 172,173,175,176 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.60 Å R-free 0.295
1N3X Ligand-free High-Affinity Maltose-Binding Protein 提交 2002-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：Deletion of residues 172,173,175,176. 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.50 Å R-free 0.241
1NL5 Engineered High-affinity Maltose-Binding Protein 提交 2003-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：M321A Q325A, deletion of residues 172,173,175,176 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；PEG 3350, Zinc Chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.10 Å R-free 0.290
1NMU MBP-L30 提交 2003-01-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Sodium Citrate, Tris, Sodium Chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.31 Å R-free 0.254
1NMU MBP-L30 提交 2003-01-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Sodium Citrate, Tris, Sodium Chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.31 Å R-free 0.254
1OMP CRYSTALLOGRAPHIC EVIDENCE OF A LARGE LIGAND-INDUCED HINGE-TWIST MOTION BETWEEN THE TWO DOMAINS OF THE MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN INVOLVED IN ACTIVE TRANSPORT AND CHEMOTAXIS 提交 1992-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1PEB LIGAND-FREE HIGH-AFFINITY MALTOSE-BINDING PROTEIN 提交 2003-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：M321A, Q325A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；312 K；PEG 3500, cacodylic acid, zinc acetate, sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 312K
分辨率 2.60 Å R-free 0.242
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
链 P 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
链 Z 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1R6Z The Crystal Structure of the Argonaute2 PAZ domain (as a MBP fusion) 提交 2003-10-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 Z 27–392（366 aa） 片段：MBP (residues 28-392) fused with Argonaute2 PAZ domain (residues 591-726)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；PEG2KMME, NiCl2, TrisHCl, NaF, meso-erythritol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
1SVX Crystal structure of a designed selected Ankyrin Repeat protein in complex with the Maltose Binding Protein 提交 2004-03-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 29–392（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 6000, 0.1M Tris, 0.1M NaCl, pH 8-9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.24 Å R-free 0.249
1T0K Joint X-ray and NMR Refinement of Yeast L30e-mRNA complex 提交 2004-04-09 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Lithium Sulfate, Sodium Cacodylate, Magnesium Chloride, Jeffamine, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.24 Å R-free 0.320
1Y4C Designed Helical Protein fusion MBP 提交 2004-11-30 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
1YTV Maltose-binding protein fusion to a C-terminal fragment of the V1a vasopressin receptor 提交 2005-02-11 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa） 片段：c-terminal residues 27-392
链 B 27–392（366 aa） 片段：c-terminal residues 27-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2M Ammonium sulfate, 25%(v/v)PEG 400 and 25%(v/v) glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1ZIU Crystal Structure of nickel-bound engineered Maltose Binding Protein 提交 2005-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa） 片段：residues 27-396
突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E NI NICKEL (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, nickel chloride, Tris-HCl, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
1ZJL Crystal structure of zinc-bound engineered maltose binding protein 提交 2005-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa） 片段：residues 27-396
突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, zinc acetate, HEPES, sodium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
1ZKB Zinc-free Engineered maltose binding protein 提交 2005-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa） 片段：RESIDUES 27-396
突变：A66H, R63H, E111M, Y155E, W340E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, sodium acetate, Tris-HcL, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.285
1ZMG Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein 提交 2005-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa） 片段：RESIDUES 27-396
突变：A63H, R66H, E111M, Y155E, W340E CU COPPER (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 2000 MME, copper sulphate, sodium acetate, Tris-HCl, sodium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
3MBP MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTOTRIOSE 提交 1997-06-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2
分辨率 1.70 Å
4MBP MALTODEXTRIN BINDING PROTEIN WITH BOUND MALTETROSE 提交 1997-08-17 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.2；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 8000, 10 MM CITRATE, PH 6.2
分辨率 1.70 Å

共 41 个其他 PDB 条目、48 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALE_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–363； UniProt 27–389 作者链 B； PDB构建体 1–363； UniProt 27–389 作者链 C； PDB构建体 1–363； UniProt 27–389

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1a7l

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1a7l
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1a7l
沉积日期 deposition_date1998-03-16
结构标题 titleDOMINANT B-CELL EPITOPE FROM THE PRES2 REGION OF HEPATITIS B VIRUS IN THE FORM OF AN INSERTED PEPTIDE SEGMENT IN MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
关键词 keywordsTRANSPORT, PRES2, EPITOPE, HEPATITIS B, MALTOSE-BINDING PROTEIN; TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron34.80 Å
零角强度 I(0) i0218920000.00
分子量 molecular_weight123090.0 kDa
排除体积 excluded_volume155580 ų
包络体积 envelope_volume200920 ų
水化壳体积 shell_volume48049 ų
包络直径 envelope_diameter136.0 Å
壳层 Rg shell_rg41.35 Å
包络 Rg envelope_rg34.65 Å
形状 Rg shape_rg34.77 Å
总 Rg total_rg35.40 Å
总原子数 total_atoms8702
残基数 n_residues1114
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax124.1 Å
Rg (实空间) rg_real35.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.44 Å
I(0) (实空间) i0_real2.1890e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.7650e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.51 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal218900000.0000
解质量估计 total_estimate0.7993
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary46.9 Å
偏度 Skewness skewness0.234
峰度 Kurtosis kurtosis-0.449
角度范围 angular_range— – 0.2250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha73750000.0000
实空间数据点数 n_real_points46
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.802; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1a7la_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd1a7lb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like
结构域编号 domain_idd1a7lc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.94 — Periplasmic binding protein-like II
超家族 Superfamily superfamilyc.94.1 — Periplasmic binding protein-like II
家族 Family familyc.94.1.1 — Phosphate binding protein-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1a7lA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
结构域编号 domain_id1a7lA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
结构域编号 domain_id1a7lB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
结构域编号 domain_id1a7lB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
结构域编号 domain_id1a7lC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
结构域编号 domain_id1a7lC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology190 — D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Periplasmic binding protein-like II
▶

8. 引用文献 (2)

▶

9. 文件与曲线 (10)