1aip

EF-TU EF-TS COMPLEX FROM THERMUS THERMOPHILUS

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 197.5 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELONGATION FACTOR TU

Thermus thermophilus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–405 链 B； UniProt 1–405	未记录	ELONGATION FACTOR TS × 2 （P43895）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–405 链 F； UniProt 1–405	未记录	ELONGATION FACTOR TS × 2 （P43895）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1AIP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EXM CRYSTAL STRUCTURE OF THERMUS THERMOPHILUS ELONGATION FACTOR TU (EF-TU) IN COMPLEX WITH THE GTP ANALOGUE GPPNHP. 提交 2000-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–406（405 aa）片段：INTACT WILD-TYPE EF-TU	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM Sodium cacodylate, 5mM Magnesium sulfate, 38-44% Ammonium sulfate, 7-10 mg/mL EF-Tu, molar ratio EF-Tu:GppNHp = 1:5, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.70 Å R-free 0.243
4H9G Probing EF-Tu with a very small brominated fragment library identifies the CCA pocket 提交 2012-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–406（405 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 14J 5-bromofuran-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 1.93 Å R-free 0.184
4LBV Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.03 Å R-free 0.193
4LBV Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.03 Å R-free 0.193
4LBW Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 1.74 Å R-free 0.194
4LBW Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 1.74 Å R-free 0.194
4LBY Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.69 Å R-free 0.207
4LBZ Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.22 Å R-free 0.212
4LBZ Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.22 Å R-free 0.212
4LC0 Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.22 Å R-free 0.201
4LC0 Identifying ligand binding hot spots in proteins using brominated fragments 提交 2013-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–406（404 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；1.8M ammonium sulfate, 15% sucrose, 0.1M Tris-HCl, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.22 Å R-free 0.201

共 7 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EFTU1_THETH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405 作者链 B； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405 作者链 E； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405 作者链 F； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405

ELONGATION FACTOR TS

Thermus thermophilus

UniProt P43895

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–196 链 D； UniProt 1–196	未记录	ELONGATION FACTOR TU × 2 （P60338）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–196 链 H； UniProt 1–196	未记录	ELONGATION FACTOR TU × 2 （P60338）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；60 MM CACODYLATE, PH 6.5 70 MM AMMONIUM SULFATE 8% PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1AIP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1TFE DIMERIZATION DOMAIN OF EF-TS FROM T. THERMOPHILUS 提交 1996-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 55–196（142 aa）片段：EF-TS DIMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 55 - 196	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.285

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EFTS_THET8
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 D； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 G； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 H； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1aip
沉积日期 deposition_date	1997-04-22
结构标题 title	EF-TU EF-TS COMPLEX FROM THERMUS THERMOPHILUS
关键词 keywords	ELONGATION FACTOR, NUCLEOTIDE EXCHANGE, GTP-BINDING, COMPLEX OF TWO ELONGATION FACTORS; COMPLEX OF TWO ELONGATION FACTORS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	58.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	58.72 Å
零角强度 I(0) i0	901729000.00
分子量 molecular_weight	249760.0 kDa
排除体积 excluded_volume	312700 Å³
包络体积 envelope_volume	481880 Å³
水化壳体积 shell_volume	73238 Å³
包络直径 envelope_diameter	214.0 Å
壳层 Rg shell_rg	54.36 Å
包络 Rg envelope_rg	57.28 Å
形状 Rg shape_rg	58.72 Å
总 Rg total_rg	58.60 Å
总原子数 total_atoms	17560
残基数 n_residues	2269
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	197.5 Å
Rg (实空间) rg_real	58.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.71 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.0170e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8450e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	57.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	900500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8419
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	58.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.502
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.250
角度范围 angular_range	— – 0.1350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0008
最高正则化参数 α highest_alpha	39340000.0000
实空间数据点数 n_real_points	28
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.875; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.926; Smooth: 0.391

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ELONGATION FACTOR TU
分子量 formula_weight	44739.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,E,F
原子数 atom_count	17575

AKGEFVRTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAALTYVTAAENPNVEVKDYGDIDKAPEERARGITINTAHVEYETAKRHYSHVDCPGHADYIKNMITGAAQMDGAILVVSAADGPMPQTREHILLARQVGVPYIVVFMNKVDMVDDPELLDLVEMEVRDLLNQYEFPGDEVPVIRGSALLALEQMHRNPKTRRGENEWVDKIWELLDAIDEYIPTPVRDVDKPFLMPVEDVFTITGRGTVATGRIERGKVKVGDEVEIVGLAPETRRTVVTGVEMHRKTLQEGIAGDNVGVLLRGVSREEVERGQVLAKPGSITPHTKFEASVYVLKKEEGGRHTGFFSGYRPQFYFRTTDVTGVVQLPPGVEMVMPGDNVTFTVELIKPVALEEGLRFAIREGGRTVGAGVVTKILE

来源 Source

来源生物 organism	Thermus thermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ELONGATION FACTOR TS
分子量 formula_weight	22449.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H

MSQMELIKKLREATGAGMMDVKRALEDAGWDEEKAVQLLRERGAMKAAKKADREAREGIIGHYIHHNQRVGVLVELNCETDFVARNELFQNLAKDLAMHIAMMNPRYVSAEEIPAEELEKERQIYIQAALNEGKPQQIAEKIAEGRLKKYLEEVVLLEQPFVKDDKVKVKELIQQAIAKIGENIVVRRFCRFELGA

来源 Source

来源生物 organism	Thermus thermophilus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	15

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 44 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d1aipa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.3 — Translation proteins
家族 Family family	b.43.3.1 — Elongation factors

结构域编号 domain_id	d1aipa2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.44 — Elongation factor/aminomethyltransferase common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.44.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain
家族 Family family	b.44.1.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1aipa3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1aipb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.3 — Translation proteins
家族 Family family	b.43.3.1 — Elongation factors

结构域编号 domain_id	d1aipb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.44 — Elongation factor/aminomethyltransferase common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.44.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain
家族 Family family	b.44.1.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1aipb3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1aipc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.5.2 — UBA-like
家族 Family family	a.5.2.2 — TS-N domain

结构域编号 domain_id	d1aipc2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.43 — EF-Ts domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.43.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain
家族 Family family	d.43.1.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain

结构域编号 domain_id	d1aipd1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.5.2 — UBA-like
家族 Family family	a.5.2.2 — TS-N domain

结构域编号 domain_id	d1aipd2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.43 — EF-Ts domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.43.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain
家族 Family family	d.43.1.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain

结构域编号 domain_id	d1aipe1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.3 — Translation proteins
家族 Family family	b.43.3.1 — Elongation factors

结构域编号 domain_id	d1aipe2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.44 — Elongation factor/aminomethyltransferase common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.44.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain
家族 Family family	b.44.1.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1aipe3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1aipf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.43 — Reductase/isomerase/elongation factor common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.43.3 — Translation proteins
家族 Family family	b.43.3.1 — Elongation factors

结构域编号 domain_id	d1aipf2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.44 — Elongation factor/aminomethyltransferase common domain
超家族 Superfamily superfamily	b.44.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain
家族 Family family	b.44.1.1 — EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1aipf3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1aipg1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.5.2 — UBA-like
家族 Family family	a.5.2.2 — TS-N domain

结构域编号 domain_id	d1aipg2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.43 — EF-Ts domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.43.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain
家族 Family family	d.43.1.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain

结构域编号 domain_id	d1aiph1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.5 — RuvA C-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	a.5.2 — UBA-like
家族 Family family	a.5.2.2 — TS-N domain

结构域编号 domain_id	d1aiph2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.43 — EF-Ts domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.43.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain
家族 Family family	d.43.1.1 — Elongation factor Ts (EF-Ts), dimerisation domain

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	1aipA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1aipA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipA03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1aipB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipB03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	479 — Tetrahydropterin Synthase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Elongation factor Ts, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	1aipC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1aipC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

结构域编号 domain_id	1aipD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	479 — Tetrahydropterin Synthase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Elongation factor Ts, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	1aipD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1aipD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

结构域编号 domain_id	1aipE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1aipE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipE03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1aipF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipF03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Translation factors

结构域编号 domain_id	1aipG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	479 — Tetrahydropterin Synthase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Elongation factor Ts, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	1aipG02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1aipG03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

结构域编号 domain_id	1aipH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	479 — Tetrahydropterin Synthase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Elongation factor Ts, dimerisation domain

结构域编号 domain_id	1aipH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1aipH03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ubiquitin-associated (UBA) domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	120.300 Å
晶胞边长 b length_b	127.500 Å
晶胞边长 c length_c	123.700 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	100.000 Å
R 因子 r_factor	0.2160
R_work r_work	0.2160
R_free r_free	0.2890

EF-TU EF-TS COMPLEX FROM THERMUS THERMOPHILUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELONGATION FACTOR TU

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ELONGATION FACTOR TS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 44 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/ai/1aip/1aip.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ai/1aip/1aip.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ai/1aip/1aip.dat