SAXSdb — 1au1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTERFERON-BETA

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合同源多聚体蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 22–187 链 B； UniProt 22–187	未记录	;beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-2)-beta-D-glucopyranose-(1-3)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-quinovopyranose-(1-6)]beta-D-glucopyranose ; × 1 alpha-D-quinovopyranose-(1-6)-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.283

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	INB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–166； UniProt 22–187 作者链 B； PDB构建体 1–166； UniProt 22–187

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1au1
沉积日期 deposition_date	1997-09-09
结构标题 title	HUMAN INTERFERON-BETA CRYSTAL STRUCTURE
关键词 keywords	INTERFERON, HELICAL CYTOKINE, IMMUNE SYSTEM, CYTOKINE; INTERFERON
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.22 Å
零角强度 I(0) i0	27773900.00
分子量 molecular_weight	41160.0 kDa
排除体积 excluded_volume	51837 Å³
包络体积 envelope_volume	64486 Å³
水化壳体积 shell_volume	22226 Å³
包络直径 envelope_diameter	96.2 Å
壳层 Rg shell_rg	30.93 Å
包络 Rg envelope_rg	25.66 Å
形状 Rg shape_rg	25.18 Å
总 Rg total_rg	26.07 Å
总原子数 total_atoms	3623
残基数 n_residues	329
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	93.6 Å
Rg (实空间) rg_real	26.12 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.7770e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.8900e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	27770000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8309
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	24.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.465
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.235
角度范围 angular_range	— – 0.3050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9525000.0000
实空间数据点数 n_real_points	62
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.712; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.728; Smooth: 0.932

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	INTERFERON-BETA
分子量 formula_weight	20054.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3866

MSYNLLGFLQRSSNFQCQKLLWQLNGRLEYCLKDRMNFDIPEEIKQLQQFQKEDAALTIYEMLQNIFAIFRQDSSSTGWNETIVENLLANVYHQINHLKTVLEEKLEKEDFTRGKLMSSLHLKRYYGRILHYLKAKEYSHCAWTIVRVEILRNFYFINRLTGYLRN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	;beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-2)-beta-D-glucopyranose-(1-3)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-quinovopyranose-(1-6)]beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1137.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-quinovopyranose-(1-6)-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	326.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	81

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1au1a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.3 — Interferons/interleukin-10 (IL-10)

结构域编号 domain_id	d1au1b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.26 — 4-helical cytokines
超家族 Superfamily superfamily	a.26.1 — 4-helical cytokines
家族 Family family	a.26.1.3 — Interferons/interleukin-10 (IL-10)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1au1A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1au1B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	55.300 Å
晶胞边长 b length_b	65.900 Å
晶胞边长 c length_c	121.500 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2230
R_work r_work	0.2230
R_free r_free	0.2830

fit	/app/data/saxs_computation/au/1au1/1au1.fit
pddf	/app/data/pr_computation/au/1au1/1au1.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/au/1au1/1au1.dat

HUMAN INTERFERON-BETA CRYSTAL STRUCTURE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTERFERON-BETA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction