SAXSdb — 1awc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN ALPHA)

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	;DNA (5'-D(APAP(BRU)PGPAPCPCPGPGPAPAPGPTPAP(CBR)PAPCP(CBR)PGPGPA)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(TPTPCPCPGPGP(BRU)PGP(BRU)PAPCPTPTPCPCPGPGPTPCPAPT)-3') ; × 1 PROTEIN (GA BINDING PROTEIN BETA 1) × 1 （Q00420） water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GABPA_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–110； UniProt 320–429

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN BETA 1)

Mus musculus

UniProt Q00420

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	;DNA (5'-D(APAP(BRU)PGPAPCPCPGPGPAPAPGPTPAP(CBR)PAPCP(CBR)PGPGPA)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(TPTPCPCPGPGP(BRU)PGP(BRU)PAPCPTPTPCPCPGPGPTPCPAPT)-3') ; × 1 PROTEIN (GA BINDING PROTEIN ALPHA) × 1 （Q00422） water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GABP2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–153； UniProt 5–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1awc
沉积日期 deposition_date	1997-10-01
结构标题 title	MOUSE GABP ALPHA/BETA DOMAIN BOUND TO DNA
关键词 keywords	;COMPLEX (TRANSCRIPTION REGULATION-DNA), DNA-BINDING, NUCLEAR PROTEIN, ETS DOMAIN, ANKYRIN REPEATS, TRANSCRIPTION FACTOR, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1awc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1awc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1awc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.04 Å
Rg（电子密度）	23.73 Å
总 Rg	24.52 Å
原子数	2920
残基数	300
排除体积	49214 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1awc__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(APAP(BRU)PGPAPCPCPGPGPAPAPGPTPAP(CBR)PAPCP(CBR)PGPGP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	6712.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	2966

AAUGACCGGAAGTACACCGGA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPTPCPCPGPGP(BRU)PGP(BRU)PAPCPTPTPCPCPGPGPTPCPAP*T)-3') ;
分子量 formula_weight	6525.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E

TTCCGGUGUACTTCCGGTCAT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (GA BINDING PROTEIN ALPHA)
分子量 formula_weight	13065.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

IQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVIECEQKKLARM

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PROTEIN (GA BINDING PROTEIN BETA 1)
分子量 formula_weight	16834.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGAPFTTDWLGTSPLHLAAQYGHFSTTEVLLRAGVSRDARTKVDRTPLHMAASEGHANIVEVLLKHGADVNAKDMLKMTALHWATEHNHQEVVELLIKYGADVHTQSKFCKTAFDISIDNGNEDLAEILQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	46

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1awca_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain
家族 Family family	a.4.5.21 — ets domain

结构域编号 domain_id	d1awcb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.211 — beta-hairpin-alpha-hairpin repeat
超家族 Superfamily superfamily	d.211.1 — Ankyrin repeat
家族 Family family	d.211.1.1 — Ankyrin repeat

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1awcA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	1awcB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ankyrin repeat-containing domain

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晶胞边长 a length_a	201.600 Å
晶胞边长 b length_b	34.550 Å
晶胞边长 c length_c	59.260 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.83 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.150 Å
最低分辨率 resolution_low	6.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2110
R_free r_free	0.2820

MOUSE GABP ALPHA/BETA DOMAIN BOUND TO DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN ALPHA)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN BETA 1)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1awc__assembly_1__model_1

1awc__assembly_1__model_1 | I(q)

1awc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

MOUSE GABP ALPHA/BETA DOMAIN BOUND TO DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN ALPHA)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN (GA BINDING PROTEIN BETA 1)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1awc__assembly_1__model_1

1awc__assembly_1__model_1 | I(q)

1awc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)