SAXSdb — 1b37

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (POLYAMINE OXIDASE)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å
2	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å
3	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å
4	其他组合同源多聚体蛋白 × 6 其他聚合物 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 29–500 链 B； UniProt 29–500 链 C； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å
5	其他组合同源多聚体蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 29–500 链 B； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å
6	其他组合同源多聚体蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 29–500	片段：FAD-BINDING DOMAIN	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；pH 4.6	分辨率 1.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1B37	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H81 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN THE REDUCED STATE 提交 2001-01-24	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500 链 B 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1H81 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN THE REDUCED STATE 提交 2001-01-24	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1H82 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH GUAZATINE 提交 2001-01-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500 链 B 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GZZ N-{8-[(8-{[(E)-AMINO(IMINO)METHYL]AMINO}OCTYL)AMINO]OCTYL}GUANIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1H82 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH GUAZATINE 提交 2001-01-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GZZ N-{8-[(8-{[(E)-AMINO(IMINO)METHYL]AMINO}OCTYL)AMINO]OCTYL}GUANIDINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1H83 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH 1,8-DIAMINOOCTANE 提交 2001-01-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN 链 B 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 DIA OCTANE 1,8-DIAMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
1H83 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH 1,8-DIAMINOOCTANE 提交 2001-01-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 DIA OCTANE 1,8-DIAMINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
1H84 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 4.6 提交 2001-01-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN 链 B 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
1H84 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 4.6 提交 2001-01-24	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–500（472 aa）片段：FAD-BINDING DOMAIN	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
1H86 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 7.0 提交 2001-01-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）链 B 29–500（472 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00	分辨率 2.00 Å R-free 0.229
1H86 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 7.0 提交 2001-01-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 29–500（472 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00	分辨率 2.00 Å R-free 0.229
3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.223
3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ACT ACETATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.223
3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M 突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.223
3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPM SPERMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.219
3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.219
3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M 突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPM SPERMINE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.219
3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPD SPERMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.216
3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.216
3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 29–500（472 aa）链 B 29–500（472 aa）	突变：K300M 突变：K300M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPD SPERMIDINE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.216

共 8 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAO_MAIZE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–472； UniProt 29–500 作者链 B； PDB构建体 1–472； UniProt 29–500 作者链 C； PDB构建体 1–472； UniProt 29–500

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1b37
沉积日期 deposition_date	1998-12-17
结构标题 title	A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE
关键词 keywords	FLAVIN-DEPENDENT AMINE OXIDASE, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.77 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.58 Å
零角强度 I(0) i0	384940000.00
分子量 molecular_weight	161400.0 kDa
排除体积 excluded_volume	201740 Å³
包络体积 envelope_volume	269950 Å³
水化壳体积 shell_volume	53010 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.6 Å
壳层 Rg shell_rg	47.53 Å
包络 Rg envelope_rg	41.75 Å
形状 Rg shape_rg	42.52 Å
总 Rg total_rg	43.03 Å
总原子数 total_atoms	11389
残基数 n_residues	1383
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	138.0 Å
Rg (实空间) rg_real	42.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8490e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.8840e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	384900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8734
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	33.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.183
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.883
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	108500000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.830; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.930; Smooth: 0.929

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (POLYAMINE OXIDASE)
分子量 formula_weight	53698.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.5.3.11
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	12067

ATVGPRVIVVGAGMSGISAAKRLSEAGITDLLILEATDHIGGRMHKTNFAGINVELGANWVEGVNGGKMNPIWPIVNSTLKLRNFRSDFDYLAQNVYKEDGGVYDEDYVQKRIELADSVEEMGEKLSATLHASGRDDMSILAMQRLNEHQPNGPATPVDMVVDYYKFDYEFAEPPRVTSLQNTVPLATFSDFGDDVYFVADQRGYEAVVYYLAGQYLKTDDKSGKIVDPRLQLNKVVREIKYSPGGVTVKTEDNSVYSADYVMVSASLGVLQSDLIQFKPKLPTWKVRAIYQFDMAVYTKIFLKFPRKFWPEGKGREFFLYASSRRGYYGVWQEFEKQYPDANVLLVTVTDEESRRIEQQSDEQTKAEIMQVLRKMFPGKDVPDATDILVPRWWSDRFYKGTFSNWPVGVNRYEYDQLRAPVGRVYFTGEHTSEHYNGYVHGAYLSGIDSAEILINCAQKKMCKYHVQGKYD

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	894.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	678

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1b37a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1b37a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family family	d.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

结构域编号 domain_id	d1b37b1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1b37b2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family family	d.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

结构域编号 domain_id	d1b37c1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	c.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family family	c.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1b37c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family family	d.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1b37A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1b37A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1b37B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1b37B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1b37C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — FAD/NAD(P)-binding domain

结构域编号 domain_id	1b37C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	184.800 Å
晶胞边长 b length_b	184.800 Å
晶胞边长 c length_c	282.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/b3/1b37/1b37.fit
pddf	/app/data/pr_computation/b3/1b37/1b37.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/b3/1b37/1b37.dat

A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (POLYAMINE OXIDASE)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction