Human herpesvirus 4
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*GP*GP*GP*AP*AP*GP*CP*AP*TP*AP*TP*GP*CP*TP*TP*CP*CP*C)-3') ; × 2 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | Q69477_9GAMA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 作者链 B； PDB构建体 1–147； UniProt 23–169 |
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| 条目编号 entry_id | 1b3t |
| 沉积日期 deposition_date | 1998-12-14 |
| 结构标题 title | EBNA-1 NUCLEAR PROTEIN/DNA COMPLEX |
| 关键词 keywords | NUCLEAR PROTEIN, PROTEIN-DNA COMPLEX, DNA-BINDING, ACTIVATOR, ORIGIN-BINDING PROTEIN; PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.85 Å |
| Rg（电子密度） | 20.59 Å |
| 总 Rg | 21.45 Å |
| 原子数 | 2982 |
| 残基数 | 330 |
| 排除体积 | 50921 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1b3ta_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.8 — Viral DNA-binding domain |
| 家族 Family family | d.58.8.1 — Viral DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | d1b3tb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.8 — Viral DNA-binding domain |
| 家族 Family family | d.58.8.1 — Viral DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 1b3tA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 390 — Epstein Barr virus nuclear antigen-1, DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | 1b3tB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 390 — Epstein Barr virus nuclear antigen-1, DNA-binding domain |