SAXSdb — 1bfu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SUBTILISIN CARLSBERG

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 106–379	未记录	CA CALCIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 5.6; THEN CROSS-LINKED WITH 10% GLUTARALDEHYDE IN 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 7.5, WASHED WITH DISTILLED WATER, AND TRANSFERRED TO 20% DIOXANE.	分辨率 2.20 Å R-free 0.245

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1BFU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AF4 CRYSTAL STRUCTURE OF SUBTILISIN CARLSBERG IN ANHYDROUS DIOXANE 提交 1997-03-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 5.6; THEN CROSS-LINKED WITH 10% GLUTARALDEHYDE IN 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 7.5, WASHED WITH DISTILLED WATER, AND TRANSFERRED TO ANHYDROUS DIOXANE.	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
1AV7 SUBTILISIN CARLSBERG L-NAPHTHYL-1-ACETAMIDO BORONIC ACID INHIBITOR COMPLEX 提交 1997-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；AS GIVEN IN REFERENCE 4, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.273
1AVT SUBTILISIN CARLSBERG D-PARA-CHLOROPHENYL-1-ACETAMIDO BORONIC ACID INHIBITOR COMPLEX 提交 1997-09-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）片段：FULL PROTEIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；AS GIVEN IN REFERENCE 4, pH 7.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
1BE6 TRANS-CINNAMOYL-SUBTILISIN IN ANHYDROUS ACETONITRILE 提交 1998-05-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 TCA PHENYLETHYLENECARBOXYLIC ACID × 1 CCN ACETONITRILE × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 5.6; THEN CROSS-LINKED WITH 10% GLUTARALDEHYDE IN 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 7.5, WASHED WITH DISTILLED WATER, AND TRANSFERRED TO ANHYDROUS ACETONITRILE N-TRANS-CINNAMOYL IMIDAZOLE WAS THEN ADDED	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
1BE8 TRANS-CINNAMOYL-SUBTILISIN IN WATER 提交 1998-05-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 TCA PHENYLETHYLENECARBOXYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 3；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 5.6; THEN CROSS-LINKED WITH 10% GLUTARALDEHYDE IN 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 7.5, WASHED WITH DISTILLED WATER, AND TRANSFERRED TO WATER AND N-TRANS-CINNAMOYL IMIDAZOLE WAS ADDED., pH 3.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.223
1BFK CRYSTAL STRUCTURE OF SUBTILISIN CARLSBERG IN 40% ACETONITRILE 提交 1998-05-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 CCN ACETONITRILE × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 5.6; THEN CROSS-LINKED WITH 10% GLUTARALDEHYDE IN 13% SODIUM SULFATE, 30 MM CACODYLATE, PH 7.5, WASHED WITH DISTILLED WATER, AND TRANSFERRED TO AN AQUEOUS SYSTEM CONTAINING 40% ACETONITRILE.	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
1C3L SUBTILISIN-CARLSBERG COMPLEXED WITH XENON (8 BAR) 提交 1999-07-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 XE XENON × 1 FMT FORMIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.5；298 K；protein: 15mg/ml in acetate buffer (0.05M) plus sodium azide (10-5M). Sodium formate as the crystallizing agent(4M). Crystals as elongated needles in two weeks., pH 5.50, MICRODIALYSIS, temperature 298K	分辨率 2.16 Å R-free 0.198
1CSE THE HIGH-RESOLUTION X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN SUBTILISIN CARLSBERG AND EGLIN C, AN ELASTASE INHIBITOR FROM THE LEECH HIRUDO MEDICINALIS. STRUCTURAL ANALYSIS, SUBTILISIN STRUCTURE AND INTERFACE GEOMETRY 提交 1988-06-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.20 Å
1OYV Crystal structure of tomato inhibitor-II in a ternary complex with subtilisin Carlsberg 提交 2003-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 106–379（274 aa）链 B 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 8000, sodium malonate, sodium citrate, ethylene glycol, ethanol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
1R0R 1.1 Angstrom Resolution Structure of the Complex Between the Protein Inhibitor, OMTKY3, and the Serine Protease, Subtilisin Carlsberg 提交 2003-09-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–275（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium dihydrogen phosphate, 0.1 M Tris, and 50%(v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.10 Å R-free 0.184
1SBC THE REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF SUBTILISIN CARLSBERG AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1988-05-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1SCA ENZYME CRYSTAL STRUCTURE IN A NEAT ORGANIC SOLVENT 提交 1993-07-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1SCB ENZYME CRYSTAL STRUCTURE IN A NEAT ORGANIC SOLVENT 提交 1993-07-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 CCN ACETONITRILE × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1SCD X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF CROSS-LINKED SUBTILISM CARLSBERG IN WATER VS. ACETONITRILE 提交 1993-08-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1SCN INACTIVATION OF SUBTILISIN CARLSBERG BY N-(TERT-BUTOXYCARBONYL-ALANYL-PROLYL-PHENYLALANYL)-O-BENZOL HYDROXYLAMINE: FORMATION OF COVALENT ENZYME-INHIBITOR LINKAGE IN THE FORM OF A CARBAMATE DERIVATIVE 提交 1994-03-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 106–379（274 aa）	未记录	0EF N-(tert-butoxycarbonyl)-L-alanyl-N-[(1R)-1-(carboxyamino)-2-phenylethyl]-L-prolinamide × 1 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
1SEL CRYSTAL STRUCTURE OF SELENOSUBTILISIN AT 2.0-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-01-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1SEL CRYSTAL STRUCTURE OF SELENOSUBTILISIN AT 2.0-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-01-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 106–379（274 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1VSB SUBTILISIN CARLSBERG L-PARA-CHLOROPHENYL-1-ACETAMIDO BORONIC ACID INHIBITOR COMPLEX 提交 1997-09-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；AS GIVEN IN REFERENCE 4, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
1YU6 Crystal Structure of the Subtilisin Carlsberg:OMTKY3 Complex 提交 2005-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–275（275 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；10% ethylene glycol, 480 mM sodium malate, 75 mM sodium citrate, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.205
1YU6 Crystal Structure of the Subtilisin Carlsberg:OMTKY3 Complex 提交 2005-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–275（275 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；10% ethylene glycol, 480 mM sodium malate, 75 mM sodium citrate, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.205
2SEC STRUCTURAL COMPARISON OF TWO SERINE PROTEINASE-PROTEIN INHIBITOR COMPLEXES. EGLIN-C-SUBTILISIN CARLSBERG AND CI-2-SUBTILISIN NOVO 提交 1988-09-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 106–379（274 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
2WUV Crystallographic analysis of counter-ion effects on subtilisin enzymatic action in acetonitrile 提交 2009-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–160（55 aa）片段：RESIDUES 106-379 链 A 161–379（219 aa）片段：RESIDUES 106-379	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CS CESIUM ION × 11 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CCN ACETONITRILE × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SUBTILISIN WAS CRYSTALLIZED BY THE BATCH METHOD FROM BUFFER SOLUTION SATURATED WITH NA2SO4 ABOUT 13% (W/V) AS PRECIPITANT (32 PETSKO AND TSERNOGLOU 1976)	分辨率 2.24 Å R-free 0.231
2WUW Crystallographic analysis of counter-ion effects on subtilisin enzymatic action in acetonitrile (native data) 提交 2009-10-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 106–160（55 aa）片段：RESIDUES 106-379 链 E 161–379（219 aa）片段：RESIDUES 106-379	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CCN ACETONITRILE × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SUBTILISIN WAS CRYSTALLIZED BY THE BATCH METHOD FROM BUFFER SOLUTION SATURATED WITH NA2SO4 ABOUT 13% (W/V) AS PRECIPITANT (PETSKO AND TSERNOGLOU 1976).	分辨率 2.23 Å R-free 0.249
3UNX Bond length analysis of asp, glu and his residues in subtilisin Carlsberg at 1.26A resolution 提交 2011-11-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）片段：mature form (UNP residues 106-379)	未记录	GOL GLYCEROL × 4 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH；pH 7.5；298 K；13% w/v sodium sulfate, pH 7.5, BATCH, temperature 298K	分辨率 1.26 Å R-free 0.139
3VSB SUBTILISIN CARLSBERG D-NAPHTHYL-1-ACETAMIDO BORONIC ACID INHIBITOR COMPLEX 提交 1997-09-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）片段：FULL PROTEIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；AS GIVEN IN REFERENCE 4, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.299
4C3U Extensive counter-ion interactions with subtilisin in aqueous medium, Cs derivative 提交 2013-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 6 CS CESIUM ION × 10 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SUBTILISIN CARLSBERG WAS PURCHASED FROM SIGMA (PRODUCT CODE: P5380) AND USED FOR CRYSTALLIZATION WITHOUT FURTHER PURIFICATION. THE PROTEIN POWDER WAS DISSOLVED IN 330 MM NA CACODYLATE BUFFER AT PH 5.6 TO A CONCENTRATION OF 10 MG/ML. SUBTILISIN WAS CRYSTALLIZED BY THE BATCH METHOD FROM BUFFER SOLUTION SATURATED WITH NA2SO4 13% (W/V) AS PRECIPITANT1. LONG NEEDLE-LIKE CRYSTALS GREW OVER A PERIOD OF TWO WEEKS TO TYPICAL DIMENSIONS 50 X 50 X 400 UM X UM X UM	分辨率 2.29 Å R-free 0.234
4C3V Extensive counter-ion interactions with subtilisin in aqueous medium, no Cs soak 提交 2013-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–379（274 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SUBTILISIN CARLSBERG WAS PURCHASED FROM SIGMA (PRODUCT CODE: P5380) AND USED FOR CRYSTALLIZATION WITHOUT FURTHER PURIFICATION. THE PROTEIN POWDER WAS DISSOLVED IN 330 MM NA CACODYLATE BUFFER AT PH 5.6 TO A CONCENTRATION OF 10 MG/ML. SUBTILISIN WAS CRYSTALLIZED BY THE BATCH METHOD FROM BUFFER SOLUTION SATURATED WITH NA2SO4 13% (W/V) AS PRECIPITANT1. LONG NEEDLE-LIKE CRYSTALS GREW OVER A PERIOD OF TWO WEEKS TO TYPICAL DIMENSIONS 50 X 50 X 400 UM X UM X UM.	分辨率 2.26 Å R-free 0.226

共 25 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SUBT_BACLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 106–379

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1bfu
沉积日期 deposition_date	1998-05-22
结构标题 title	SUBTILISIN CARLSBERG IN 20% DIOXANE
关键词 keywords	SERINE PROTEASE, ORGANIC SOLVENT, MIXTURES; SERINE PROTEASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.60 Å
零角强度 I(0) i0	14014600.00
分子量 molecular_weight	27416.0 kDa
排除体积 excluded_volume	33982 Å³
包络体积 envelope_volume	36953 Å³
水化壳体积 shell_volume	18144 Å³
包络直径 envelope_diameter	54.4 Å
壳层 Rg shell_rg	23.28 Å
包络 Rg envelope_rg	16.81 Å
形状 Rg shape_rg	16.61 Å
总 Rg total_rg	17.54 Å
总原子数 total_atoms	1927
残基数 n_residues	274
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	53.1 Å
Rg (实空间) rg_real	17.66 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.20 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4010e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.4080e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.68 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	14010000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9035
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.009
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.542
角度范围 angular_range	— – 0.4450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4456000.0000
实空间数据点数 n_real_points	75
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.994

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SUBTILISIN CARLSBERG
分子量 formula_weight	27306.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.62
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2017

AQTVPYGIPLIKADKVQAQGFKGANVKVAVLDTGIQASHPDLNVVGGASFVAGEAYNTDGNGHGTHVAGTVAALDNTTGVLGVAPSVSLYAVKVLNSSGSGSYSGIVSGIEWATTNGMDVINMSLGGASGSTAMKQAVDNAYARGVVVVAAAGNSGNSGSTNTIGYPAKYDSVIAVGAVDSNSNRASFSSVGAELEVMAPGAGVYSTYPTNTYATLNGTSMASPHVAGAAALILSKHPNLSASQVRNRLSSTATYLGSSFYYGKGLINVEAAAQ

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,4-DIETHYLENE DIOXIDE
分子量 formula_weight	88.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	90

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1bfua_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.41 — Subtilisin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.41.1 — Subtilisin-like
家族 Family family	c.41.1.1 — Subtilases

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1bfuA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 — Peptidase S8/S53 domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	77.555 Å
晶胞边长 b length_b	55.173 Å
晶胞边长 c length_c	53.862 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1870
R_work r_work	0.1870
R_free r_free	0.2450

fit	/app/data/saxs_computation/bf/1bfu/1bfu.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bf/1bfu/1bfu.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bf/1bfu/1bfu.dat

SUBTILISIN CARLSBERG IN 20% DIOXANE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SUBTILISIN CARLSBERG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction