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1bm6

SOLUTION STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN STROMELYSIN-1 COMPLEXED TO A POTENT NON-PEPTIDIC INHIBITOR, NMR, 20 STRUCTURES

Method: SOLUTION NMR Dmax: 58.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

STROMELYSIN-1

Homo sapiens

UniProt P08254

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 100–272 未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 HAV HYDROXYAMINOVALINE × 1 3MP 3-METHYLPYRIDINE × 1 MSB 1-METHYLOXY-4-SULFONE-BENZENE × 1 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.8；310 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1BM6 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1B3D STROMELYSIN-1 提交 1998-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 S27 N-[[2-METHYL-4-HYDROXYCARBAMOYL]BUT-4-YL-N]-BENZYL-P-[PHENYL]-P-[METHYL]PHOSPHINAMID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-PROPANOL, 10 MM CACL2 0.1 M TRIS-HCL BUFFER, PH 7.5-8.5, pH 7.4
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
1B8Y X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATIONS FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–266（167 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 IN7 [4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
1B8Y X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATIONS FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–266（167 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 IN7 [4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.214
1BIW DESIGN AND SYNTHESIS OF CONFORMATIONALLY-CONSTRAINED MMP INHIBITORS 提交 1998-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 S80 N1-HYDROXY-2-(3-HYDROXY-PROPYL)-3-ISOBUTYL-N4-[1-(2-METHOXY-ETHYL)-2-OXO-AZEPAN-3-YL]-SUCCINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；10 MG/ML PROTEIN IN 20-24% PEG 8000, 2.5% 2-PROPANOL, 10MM CACL2 AND 0.1M TRIS HCL BUFFER, PH 7.5-8.0
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 9 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1C3I HUMAN STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, POTASSIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, CACODYLATE, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.83 Å
1C3I HUMAN STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, POTASSIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, CACODYLATE, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.83 Å
1C8T HUMAN STROMELYSIN-1 (E202Q) CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 103–269（167 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
链 B 103–269（167 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
突变：E202Q, S252P 突变：E202Q, S252P ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, potassium chloride, calcium chloride, cacodylate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.60 Å
1CAQ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1CAQ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1CIZ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.64 Å R-free 0.245
1CIZ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 1.64 Å R-free 0.245
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa）
链 B 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K
分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1D5J CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A THIAZEPINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MM3 N-HYDROXY-4-[(4-METHOXYLPHENYL)SULFONYL]-2,2-DIMETHYL-HEXAHYDRO-1,4-THIAZEPINE-3(S)-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NACL, MGCL2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1D5J CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A THIAZEPINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MM3 N-HYDROXY-4-[(4-METHOXYLPHENYL)SULFONYL]-2,2-DIMETHYL-HEXAHYDRO-1,4-THIAZEPINE-3(S)-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NACL, MGCL2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1D7X CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A MODIFIED PROLINE SCAFFOLD BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SPC N-HYDROXY 1N(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL-4-(Z,E-N-METHOXYIMINO)PYRROLIDINE-2R-CARBOXAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, MAGNESIUM CHLORIDE, TRIS, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.227
1D8F CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A PIPERAZINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
1D8F CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A PIPERAZINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SPI N-HYDROXY-1-(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL-4-BENZYLOXYCARBONYL-PIPERAZINE-2-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
1D8M CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A HETEROCYCLE-BASED INHIBITOR 提交 1999-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.44 Å R-free 0.315
1D8M CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A HETEROCYCLE-BASED INHIBITOR 提交 1999-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 BBH 1-BENZYL-3-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-6-OXO-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-4-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.44 Å R-free 0.315
1G05 HETEROCYCLE-BASED MMP INHIBITOR WITH P2'SUBSTITUENTS 提交 2000-10-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.45 Å R-free 0.293
1G05 HETEROCYCLE-BASED MMP INHIBITOR WITH P2'SUBSTITUENTS 提交 2000-10-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 BBH 1-BENZYL-3-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-6-OXO-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-4-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.45 Å R-free 0.293
1G49 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2000-10-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NaCl, MgCl2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.253
1G49 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2000-10-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 111 (1N)-4-N-BUTOXYPHENYLSULFONYL-(2R)-N-HYDROXYCARBOXAMIDO-(4S)-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NaCl, MgCl2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.253
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 83–250（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 83–250（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 83–250（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1HFS CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE N-CARBOXY-ALKYL INHIBITOR L-764,004 提交 1997-02-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–264（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 L04 6-(4'-FLUORO-BIPHENYL-4-YL)-4-(3-METHYL-1-PHENYLCARBAMOYL-BUTYLCARBAMOYL)-2-[4-(1-OXO-1,3-DIHYDRO-ISOINDOL-2-YL)-BUTYL]-HEXANOIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.217
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
链 B 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1OO9 Orientation in Solution of MMP-3 Catalytic Domain and N-TIMP-1 from Residual Dipolar Couplings 提交 2003-03-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.7；307 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2;1mM Sodium Azide；压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM MMP-3 U-15N, 13C; 0.8mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.5mM MMP-3 U-2H, 15N; 0.5mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.66mM N-TIMP-1 U-15N, 13C; 0.66mM MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM MMP-3 (E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol | 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol
分辨率未提供
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
链 C 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
链 D 106–267（162 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 106–266（161 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 106–266（161 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 106–266（161 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 106–266（161 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1SLM CRYSTAL STRUCTURE OF FIBROBLAST STROMELYSIN-1: THE C-TRUNCATED HUMAN PROENZYME 提交 1995-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 18–272（255 aa） 片段：PROPEPTIDE, CATALYTIC
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. 2.0 MICROLITER DROPS OF PROENZYME SOLUTION (10 MG/ML PROTEIN, 5.0 MILLIMOLAR CALCIUM CHLORIDE, 50 MICROMOLAR ZINC ACETATE, 0.02% SODIUM AZIDE, 20 MILLIMOLAR MES, PH 6.5, 0.02 MOLE INHIBITOR PER MOLE PROENZYME) WERE MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR BUFFER (14% PEG-6000, 5% SATURATED SODIUM CITRATE, 0.02% SODIUM AZIDE, 0.1 M CACODYLATE, PH 5.8) AND INCUBATED AT 4 DEGREES CENTIGRADE., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
1SLN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE N-CARBOXY-ALKYL INHIBITOR L-702,842 提交 1995-08-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 255
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 8MI N-(R-CARBOXY-ETHYL)-ALPHA-(S)-(2-PHENYLETHYL)GLYCYL-L-ARGININE-N-PHENYLAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.54；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. 1.5 MICROLITER DROPS OF ENZYME:INHIBITOR SOLUTION (9 MG/ML ENZYME, 1.5 MILLIMOLAR INHIBITOR, 5.0 MILLIMOLAR CALCIUM CHLORIDE, 0.02% SODIUM AZIDE, 20 MILLIMOLAR TRIS HYDROCHLORIDE, PH 7.5) WERE MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR BUFFER (10% PEG-6000, 15% SATURATED AMMONIUM ACETATE 0.02% SODIUM AZIDE, 0.1 M CACODYLATE, PH 5.54) AND INCUBATED AT ROOM TEMPERATURE., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.27 Å R-free 0.299
1UEA MMP-3/TIMP-1 COMPLEX 提交 1997-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1UEA MMP-3/TIMP-1 COMPLEX 提交 1997-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 100–272（173 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1UMS STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN WITH HYDROPHOBIC INHIBITOR BOUND, PH 7.0, 32OC, 20 MM CACL2, 15% ACETONITRILE; NMR ENSEMBLE OF 20 STRUCTURES 提交 1995-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–273（174 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 256
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 0DS N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-L-leucyl-L-phenylalaninamide × 1 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1UMT Stromelysin-1 catalytic domain with hydrophobic inhibitor bound, ph 7.0, 32oc, 20 mm cacl2, 15% acetonitrile; nmr average of 20 structures minimized with restraints 提交 1995-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–273（174 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 256
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 0DS N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-L-leucyl-L-phenylalaninamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；305 K；压力 ambient
NMR样品组成 1.0-1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] double labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] double labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 15N] N15 labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–264（165 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247
未记录 ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.80 Å
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 100–264（165 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247
未记录 ZN ZINC ION × 9 CA CALCIUM ION × 9 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.80 Å
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–264（165 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247
未记录 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 6 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.80 Å
2D1O Stromelysin-1 (MMP-3) complexed to a hydroxamic acid inhibitor 提交 2005-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–270（171 aa） 片段：C-Terminal catalytic domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 FA4 SM-25453 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG400, MPD, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.02 Å R-free 0.206
2D1O Stromelysin-1 (MMP-3) complexed to a hydroxamic acid inhibitor 提交 2005-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–270（171 aa） 片段：C-Terminal catalytic domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 FA4 SM-25453 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG400, MPD, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.02 Å R-free 0.206
2JNP Solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of N-isobutyl-N-[4-methoxyphenylsulfonyl]glycyl hydroxamic acid (NNGH) 提交 2007-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–265（161 aa） 片段：residues 88-248
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Tris 0.02, NaCl 3；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-99% 15N] MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JT5 solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of n-hydroxy-2-[n-(2-hydroxyethyl)biphenyl-4-sulfonamide] hydroxamic acid (MLC88) 提交 2007-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–265（161 aa） 片段：sequence database residues 105-265
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 JT5 N~2~-(biphenyl-4-ylsulfonyl)-N-hydroxy-N~2~-(2-hydroxyethyl)glycinamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JT6 Solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of 3-4'-cyanobyphenyl-4-yloxy)-n-hdydroxypropionamide (MMP-3 inhibitor VII) 提交 2007-07-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–265（161 aa） 片段：sequence database residues 105-265
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 JT6 3-[(4'-cyanobiphenyl-4-yl)oxy]-N-hydroxypropanamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] entity_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2SRT CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN STROMELYSIN-1 AT PH 5.5 AND 40OC COMPLEXED WITH INHIBITOR 提交 1995-03-22 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 8MI N-(R-CARBOXY-ETHYL)-ALPHA-(S)-(2-PHENYLETHYL)GLYCYL-L-ARGININE-N-PHENYLAMIDE × 1 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-141803 提交 1998-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–264（165 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247
未记录 ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 IN8 [2-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2-YLCARBAMOYL)-1-PHENYL-ETHYL]-CARBAMIC ACID BENZYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.20 Å
3OHL catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methoxy-N-(pyridine-3-ylmethyl)phenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–266（167 aa） 片段：UNP residues 100-266
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 OHL N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-N~2~-(pyridin-4-ylmethyl)glycinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 29% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.283
3OHL catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methoxy-N-(pyridine-3-ylmethyl)phenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–266（167 aa） 片段：UNP residues 100-266
未记录 CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 OHL N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-N~2~-(pyridin-4-ylmethyl)glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 29% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.283
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–268（169 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–268（169 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–268（169 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3USN STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE THIADIAZOLE INHIBITOR IPNU-107859, NMR, 1 STRUCTURE 提交 1998-06-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–267（168 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83(1) - 250(168)
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 ATT 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2-YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PHENYL-PROPIONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；300 K
分辨率未提供
4DPE Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor. 提交 2012-02-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：unp residues 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.96 Å R-free 0.231
4DPE Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor. 提交 2012-02-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：unp residues 100-272
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.96 Å R-free 0.231
4G9L Structure of MMP3 complexed with NNGH inhibitor. 提交 2012-07-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：catalytic domain (unp residues 100-272)
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.88 Å R-free 0.270
4G9L Structure of MMP3 complexed with NNGH inhibitor. 提交 2012-07-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：catalytic domain (unp residues 100-272)
未记录 ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.88 Å R-free 0.270
4JA1 Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor 提交 2013-02-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：catalytic domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Protein 7-15mg/ml, 25-30% (w/v) PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.96 Å R-free 0.244
4JA1 Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor 提交 2013-02-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–272（173 aa） 片段：catalytic domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Protein 7-15mg/ml, 25-30% (w/v) PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.96 Å R-free 0.244
6MAV Complex of tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) mutant L34G with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–267（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Ammonium Acetate 0.1 M Bis-Tris: HCl, pH 5.5, 17 % (w/v) PEG 10,000
分辨率 2.37 Å R-free 0.298
6N9D Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/L133P/L151C/G154A) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–264（165 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Sodium Cacodylate: HCl, pH 6.5 18 % (w/v) PEG 8000
分辨率 2.67 Å R-free 0.258
7S7L Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66S/E67Y/L133N/S155L) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 100-272)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；310 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350 Anatrace-Microlytic Top96 #65
分辨率 2.34 Å R-free 0.239
7S7M Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66D/T98G/P131S/Q153N) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 100–272（173 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 100-272)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；310 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5, 17% w/v PEG10000
分辨率 3.00 Å R-free 0.248

共 43 个其他 PDB 条目、80 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MM03_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–173； UniProt 100–272

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bm6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bm6
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bm6
沉积日期 deposition_date1998-07-29
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN STROMELYSIN-1 COMPLEXED TO A POTENT NON-PEPTIDIC INHIBITOR, NMR, 20 STRUCTURES
关键词 keywordsHYDROLASE, METALLOPROTEASE, METZINCINS; METALLOPROTEASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.34 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron15.14 Å
零角强度 I(0) i02199660000.00
分子量 molecular_weight399840.0 kDa
排除体积 excluded_volume498140 ų
包络体积 envelope_volume41426 ų
水化壳体积 shell_volume18969 ų
包络直径 envelope_diameter63.7 Å
壳层 Rg shell_rg25.12 Å
包络 Rg envelope_rg19.08 Å
形状 Rg shape_rg15.15 Å
总 Rg total_rg15.24 Å
总原子数 total_atoms54560
残基数 n_residues3460
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax58.4 Å
Rg (实空间) rg_real15.32 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.60 Å
I(0) (实空间) i0_real2.2000e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8710e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.32 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2200000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7938
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary18.5 Å
偏度 Skewness skewness0.427
峰度 Kurtosis kurtosis0.271
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1087000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.484; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.868; Smooth: 0.996
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1bm6a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.11 — Matrix metalloproteases, catalytic domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1bm6A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagenase (Catalytic Domain)
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)