SAXSdb — 1bwu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (AGGLUTININ)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38784） PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38784） alpha-D-mannopyranose × 14 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38784） alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38784） alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q38789_ALLSA
Isoform	—
PDB实体	1, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–106； UniProt 177–282 作者链 P； PDB构建体 1–106； UniProt 18–123

PROTEIN (AGGLUTININ)

物种未注明

UniProt Q38784

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38789） PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38789） alpha-D-mannopyranose × 14 water × 4	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38789） alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN (AGGLUTININ) × 1 （Q38789） alpha-D-mannopyranose × 7 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q38784_ALLSA
Isoform	—
PDB实体	2, 4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–109； UniProt 25–133 作者链 Q； PDB构建体 1–109； UniProt 25–133

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1bwu
沉积日期 deposition_date	1998-09-28
结构标题 title	MANNOSE-SPECIFIC AGGLUTININ (LECTIN) FROM GARLIC (ALLIUM SATIVUM) BULBS COMPLEXED WITH ALPHA-D-MANNOSE
关键词 keywords	BULB LECTIN, MANNOSE, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1bwu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1bwu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1bwu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.29 Å
Rg（电子密度）	26.48 Å
总 Rg	27.26 Å
原子数	3527
残基数	430
排除体积	61675 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1bwu__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1bwu__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1bwu__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (AGGLUTININ)
分子量 formula_weight	11865.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3664

RNILRNDEGLYGGQSLDVNPYHFIMQEDCNLVLYDHSTSVWASNTGILGKKGCRAVLQSDGNFVVYDAEGRSLWASHSVRGNGNYVLVLQEDGNVVIYRSDIWSTN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (AGGLUTININ)
分子量 formula_weight	12124.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

RNILTNDEGLYGGQSLDVNPYHLIMQEDCNLVLYDHSTAVWSSNTDIPGKKGCKAVLQSDGNFVVYDAEGASLWASHSVRGNGNYVLVLQEDGNVVIYRSDIWSTNTYR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (AGGLUTININ)
分子量 formula_weight	11678.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

RNILTNDEGLYAGQSLDVNPYHFIMQEDCNLVLYDHSTSVWASNTGILGKKGCKAVLQADGNFVVYDAEGRSLWASHSVRGNGNYVLVLQEDGNVVIYGSDIWSTN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PROTEIN (AGGLUTININ)
分子量 formula_weight	12010.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

RNILTNDEGLYAGQSLDVNPYHLIMQEDCNLVLYDHSTAVWSSNTDIPGKKGCKAVLQSDGNFVVYDAEGASLWASHSVRGNGNYVLVLQEDGNVVIYGSDIWSTNTYK

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	alpha-D-mannopyranose
分子量 formula_weight	180.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	137

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1bwua_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamily	b.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family family	b.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins

结构域编号 domain_id	d1bwud_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamily	b.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family family	b.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins

结构域编号 domain_id	d1bwup_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamily	b.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family family	b.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins

结构域编号 domain_id	d1bwuq_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.78 — beta-Prism II
超家族 Superfamily superfamily	b.78.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins
家族 Family family	b.78.1.1 — alpha-D-mannose-specific plant lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1bwuA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology	10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bulb-type lectin domain

结构域编号 domain_id	1bwuD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology	10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bulb-type lectin domain

结构域编号 domain_id	1bwuP00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology	10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bulb-type lectin domain

结构域编号 domain_id	1bwuQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	90 — Orthogonal Prism
拓扑 Topology topology	10 — Agglutinin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bulb-type lectin domain

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晶胞边长 a length_a	203.243 Å
晶胞边长 b length_b	43.780 Å
晶胞边长 c length_c	79.268 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.37 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	9.000 Å
R 因子 r_factor	0.2260
R_work r_work	0.2260
R_free r_free	0.2780

MANNOSE-SPECIFIC AGGLUTININ (LECTIN) FROM GARLIC (ALLIUM SATIVUM) BULBS COMPLEXED WITH ALPHA-D-MANNOSE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (AGGLUTININ)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (AGGLUTININ)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1bwu__assembly_1__model_1

1bwu__assembly_1__model_1 | I(q)

1bwu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)

MANNOSE-SPECIFIC AGGLUTININ (LECTIN) FROM GARLIC (ALLIUM SATIVUM) BULBS COMPLEXED WITH ALPHA-D-MANNOSE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (AGGLUTININ)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN (AGGLUTININ)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1bwu__assembly_1__model_1

1bwu__assembly_1__model_1 | I(q)

1bwu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)