1bzb

GLYCOSYLATED EEL CALCITONIN

Method: SOLUTION NMR Dmax: 71.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (CALCITONIN)

物种未注明

UniProt P01262

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–32 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 4.5;308 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALC_ANGJA
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–32; UniProt 1–32

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bzb

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bzb
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bzb
沉积日期 deposition_date1998-10-27
结构标题 titleGLYCOSYLATED EEL CALCITONIN
关键词 keywordsHORMONE, CALCIUM-REGULATOR, OSTEOPOROSIS, HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX; HORMONE/GROWTH FACTOR
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.92
回转半径 Rg (电子) rg_electron15.55
零角强度 I(0) i039025000.00
分子量 molecular_weight48036.0 kDa
排除体积 excluded_volume59412 ų
包络体积 envelope_volume30823 ų
水化壳体积 shell_volume14571 ų
包络直径 envelope_diameter73.6
壳层 Rg shell_rg23.90
包络 Rg envelope_rg19.18
形状 Rg shape_rg15.52
总 Rg total_rg16.31
总原子数 total_atoms6609
残基数 n_residues320
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax71.5
Rg (实空间) rg_real16.16
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.01
I(0) (实空间) i0_real3.9030e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.7780e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal16.13
I(0) (倒空间) i0_reciprocal39020000.0000
解质量估计 total_estimate0.6048
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary19.0
偏度 Skewness skewness0.579
峰度 Kurtosis kurtosis0.218
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha51690.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.253; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.100; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1bzba_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.6 — Peptide hormones
超家族 Superfamily superfamilyj.6.1 — Peptide hormones
家族 Family familyj.6.1.1 — Peptide hormones

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)