1bzv

[D-ALAB26]-DES(B27-B30)-INSULIN-B26-AMIDE A SUPERPOTENT SINGLE-REPLACEMENT INSULIN ANALOGUE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

Method: SOLUTION NMR Dmax: 39.0 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INSULIN

物种未注明

UniProt P01312

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 31–51 突变:CHAIN B, TYR(B26)D-ALA INSULIN × 1 (P30410) SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 2;298 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INS_BALPH
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–21; UniProt 31–51

INSULIN

synthetic construct

UniProt P30410

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 25–49 突变:CHAIN B, TYR(B26)D-ALA 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) INSULIN × 1 (P01312) SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 2;298 K 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INS_PANTR
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–25; UniProt 25–49

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bzv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bzv
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bzv
沉积日期 deposition_date1998-11-04
结构标题 title[D-ALAB26]-DES(B27-B30)-INSULIN-B26-AMIDE A SUPERPOTENT SINGLE-REPLACEMENT INSULIN ANALOGUE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywordsINSULIN, SUPERPOTENCY, HORMONE; HORMONE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier11.63
回转半径 Rg (电子) rg_electron10.14
零角强度 I(0) i0727779.00
分子量 molecular_weight5258.0 kDa
排除体积 excluded_volume6503 ų
包络体积 envelope_volume7620 ų
水化壳体积 shell_volume6784 ų
包络直径 envelope_diameter35.8
壳层 Rg shell_rg15.05
包络 Rg envelope_rg10.53
形状 Rg shape_rg10.14
总 Rg total_rg11.64
总原子数 total_atoms366
残基数 n_residues46
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax39.0
Rg (实空间) rg_real11.60
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.29
I(0) (实空间) i0_real7.2780e+05
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.6370e+03
Rg (倒空间) rg_reciprocal11.60
I(0) (倒空间) i0_reciprocal727800.0000
解质量估计 total_estimate0.8874
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary14.3
偏度 Skewness skewness0.231
峰度 Kurtosis kurtosis-0.284
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha78590.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.972

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1bzv.1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.1 — Insulin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.1.1 — Insulin-like
家族 Family familyg.1.1.1 — Insulin-like

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)