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1cia

REPLACEMENT OF CATALYTIC HISTIDINE-195 OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE: EVIDENCE FOR A GENERAL BASE ROLE FOR GLUTAMATE

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 59.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE

Escherichia coli

UniProt P00484

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–213 未记录 CO COBALT (II) ION × 6 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 2.50 Å
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–213 未记录 CO COBALT (II) ION × 12 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 2.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1CIA Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1CLA EVIDENCE FOR TRANSITION-STATE STABILIZATION BY SERINE-148 IN THE CATALYTIC MECHANISM OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1989-10-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.34 Å
1CLA EVIDENCE FOR TRANSITION-STATE STABILIZATION BY SERINE-148 IN THE CATALYTIC MECHANISM OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1989-10-16 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.34 Å
1QCA QUADRUPLE MUTANT Q92C, N146F, Y168F, I172V TYPE III CAT COMPLEXED WITH FUSIDIC ACID. CRYSTALS GROWN AT PH 6.3. X-RAY DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE 提交 1995-08-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–213（213 aa）
突变：Q92C, N146F, Y168F, I172V CO COBALT (II) ION × 6 FUA FUSIDIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；pH 6.3
分辨率 2.20 Å
1QCA QUADRUPLE MUTANT Q92C, N146F, Y168F, I172V TYPE III CAT COMPLEXED WITH FUSIDIC ACID. CRYSTALS GROWN AT PH 6.3. X-RAY DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE 提交 1995-08-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–213（213 aa）
突变：Q92C, N146F, Y168F, I172V CO COBALT (II) ION × 12 FUA FUSIDIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；pH 6.3
分辨率 2.20 Å
2CLA CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASP-199-ASN MUTANT OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE TO 2.35 ANGSTROMS RESOLUTION. STRUCTURAL CONSEQUENCES OF DISRUPTION OF A BURIED SALT-BRIDGE 提交 1990-04-05 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
2CLA CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASP-199-ASN MUTANT OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE TO 2.35 ANGSTROMS RESOLUTION. STRUCTURAL CONSEQUENCES OF DISRUPTION OF A BURIED SALT-BRIDGE 提交 1990-04-05 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å
3CLA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE AT 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-07-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.75 Å
3CLA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE AT 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-07-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.75 Å
4CLA ALTERNATIVE BINDING MODES FOR CHLORAMPHENICOL AND 1-SUBSTITUTED CHLORAMPHENICOL ANALOGUES REVEALED BY SITE-DIRECTED MUTAGENESIS AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1990-10-23 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
4CLA ALTERNATIVE BINDING MODES FOR CHLORAMPHENICOL AND 1-SUBSTITUTED CHLORAMPHENICOL ANALOGUES REVEALED BY SITE-DIRECTED MUTAGENESIS AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1990-10-23 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
6X7Q Chloramphenicol acetyltransferase type III in complex with chloramphenicol and acetyl-oxa(dethia)-CoA 提交 2020-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–213（212 aa）
链 B 2–213（212 aa）
链 C 2–213（212 aa）
未记录 UTA acetyl-oxa(dethia)-CoA × 3 ZN ZINC ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CLM CHLORAMPHENICOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM magnesium chloride, 100 mM sodium citrate:citric acid, pH 5.5, 46% PEG400
分辨率 1.68 Å R-free 0.201

共 6 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CAT3_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1cia

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1cia
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1cia
沉积日期 deposition_date1993-07-19
结构标题 titleREPLACEMENT OF CATALYTIC HISTIDINE-195 OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE: EVIDENCE FOR A GENERAL BASE ROLE FOR GLUTAMATE
关键词 keywordsTRANSFERASE(ACYLTRANSFERASE); TRANSFERASE(ACYLTRANSFERASE)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.59 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.41 Å
零角强度 I(0) i09749590.00
分子量 molecular_weight23995.0 kDa
排除体积 excluded_volume30323 ų
包络体积 envelope_volume34769 ų
水化壳体积 shell_volume16929 ų
包络直径 envelope_diameter57.8 Å
壳层 Rg shell_rg23.31 Å
包络 Rg envelope_rg17.62 Å
形状 Rg shape_rg17.43 Å
总 Rg total_rg18.37 Å
总原子数 total_atoms1691
残基数 n_residues213
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax59.4 Å
Rg (实空间) rg_real18.49 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.25 Å
I(0) (实空间) i0_real9.7500e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1550e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.50 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal9750000.0000
解质量估计 total_estimate0.8970
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary23.6 Å
偏度 Skewness skewness0.166
峰度 Kurtosis kurtosis-0.404
角度范围 angular_range— – 0.4300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha1563000.0000
实空间数据点数 n_real_points74
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.889; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.993
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ciaa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.43 — CoA-dependent acyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.43.1 — CoA-dependent acyltransferases
家族 Family familyc.43.1.1 — CAT-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1ciaA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology559 — Chloramphenicol Acetyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Chloramphenicol acetyltransferase-like domain
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)