1com

THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 146.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CHORISMATE MUTASE

Bacillus subtilis

UniProt P19080

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–127 链 B； UniProt 1–127 链 C； UniProt 1–127	未记录	PRE PREPHENIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.20 Å
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–127 链 K； UniProt 1–127 链 L； UniProt 1–127	未记录	PRE PREPHENIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.20 Å
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–127 链 E； UniProt 1–127 链 F； UniProt 1–127	未记录	PRE PREPHENIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.20 Å
4	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–127 链 H； UniProt 1–127 链 I； UniProt 1–127	未记录	PRE PREPHENIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1COM	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DBF CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AT 1.30 ANGSTROM 提交 1999-11-02	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 9 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3；298 K；PROTEIN DROP: 5 MICROLITERS PROTEIN SOLUTION, 5 MICROLITERS RESERVOIR. PROTEIN SOLUTION: 13 MG/ML PROTEIN, 100 MM PMSF, 100 MM NACL, 50 MM TRIS PH 7.5, 1 MM EDTA, 1 MM DTT. RESERVOIR SOLUTION: 2.2 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE PH 3.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.235
1FNJ CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CHORISMATE MUTASE MUTANT C88S/R90K 提交 2000-08-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein solution: 10 mM Tris-HCl, 2mM DTT, 0.125 mM EDTA, Reservoir solution: 30% PEG 400, 50 mM Tris-HCl, 50 mM Magnesium Chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.90 Å R-free 0.221
1FNK CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CHORISMATE MUTASE MUTANT C88K/R90S 提交 2000-08-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein solution: 10 mM Tris-HCl, 2mM DTT, 0.125 mM EDTA, Reservoir solution: 30% PEG 400, 50 mM Tris-HCl, 50 mM magnesium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.251
2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–127（127 aa）链 K 1–127（127 aa）链 L 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–127（127 aa）链 H 1–127（127 aa）链 I 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	未记录	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	未记录	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–127（127 aa）链 H 1–127（127 aa）链 I 1–127（127 aa）	未记录	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08	配体/离子不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 1–127（127 aa）链 K 1–127（127 aa）链 L 1–127（127 aa）	未记录	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å
3ZO8 Wild-type chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 100 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.59 Å R-free 0.170
3ZO8 Wild-type chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 100 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.59 Å R-free 0.170
3ZOP Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 150 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.61 Å R-free 0.221
3ZOP Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 150 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.61 Å R-free 0.221
3ZP4 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with a transition state analog 提交 2013-02-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER - MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY - PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 24% W/V PEG 1000	分辨率 1.80 Å R-free 0.231
3ZP4 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with a transition state analog 提交 2013-02-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER - MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY - PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 24% W/V PEG 1000	分辨率 1.80 Å R-free 0.231
3ZP7 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with chorismate and prephenate 提交 2013-02-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–127（127 aa）链 E 1–127（127 aa）链 F 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PRE PREPHENIC ACID × 2 ISJ (3R,4R)-3-[(1-carboxyethenyl)oxy]-4-hydroxycyclohexa-1,5-diene-1-carboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.70 Å R-free 0.218
3ZP7 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with chorismate and prephenate 提交 2013-02-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–127（127 aa）链 B 1–127（127 aa）链 C 1–127（127 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PRE PREPHENIC ACID × 3 ISJ (3R,4R)-3-[(1-carboxyethenyl)oxy]-4-hydroxycyclohexa-1,5-diene-1-carboxylic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000	分辨率 1.70 Å R-free 0.218

共 9 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHMU_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 B； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 C； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 D； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 E； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 G； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 H； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 I； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 J； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 K； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 L； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1com
沉积日期 deposition_date	1994-04-08
结构标题 title	THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION
关键词 keywords	CHORISMATE MUTASE; CHORISMATE MUTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.32 Å
零角强度 I(0) i0	374065000.00
分子量 molecular_weight	159820.0 kDa
排除体积 excluded_volume	200920 Å³
包络体积 envelope_volume	268640 Å³
水化壳体积 shell_volume	52749 Å³
包络直径 envelope_diameter	152.0 Å
壳层 Rg shell_rg	47.18 Å
包络 Rg envelope_rg	42.14 Å
形状 Rg shape_rg	43.34 Å
总 Rg total_rg	43.46 Å
总原子数 total_atoms	13616
残基数 n_residues	1386
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	146.1 Å
Rg (实空间) rg_real	43.54 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.4880e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	374000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8224
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	60.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.320
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.309
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	230100000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.682; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.936; Smooth: 0.706

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CHORISMATE MUTASE
分子量 formula_weight	14507.9 kDa
EC 编号 ec_number	5.4.99.5
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	15125

MMIRGIRGATTVERDTEEEILQKTKQLLEKIIEENHTKPEDVVQMLLSATPDLHAVFPAKAVRELSGWQYVPVTCMQEMDVTGGLKKCIRVMMTVQTDVPQDQIRHVYLEKAVVLRPDLSLTKNTEL

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PREPHENIC ACID
分子量 formula_weight	226.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	503

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d1coma_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comc_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1come_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comf_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comg_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comh_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comi_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comj_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1comk_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

结构域编号 domain_id	d1coml_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.79 — Bacillus chorismate mutase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.79.1 — YjgF-like
家族 Family family	d.79.1.2 — Chorismate mutase

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1comA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

结构域编号 domain_id	1comL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — RutC-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	102.400 Å
晶胞边长 b length_b	68.300 Å
晶胞边长 c length_c	102.800 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	105.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	0.1790
R_work r_work	0.1790
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/co/1com/1com.fit
pddf	/app/data/pr_computation/co/1com/1com.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/co/1com/1com.dat