SAXSdb — 1cpz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Copper chaperone

Enterococcus hirae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 3–69	突变：N-TERMINUS CHANGED FROM MKQ TO AQ	无其他共同聚合物	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；288.2 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NMR样品组成：10% D2O/90% H2O, 10UM NA2S2O4, 50MM NAPI	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A1V8XBM5_ENTHR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–68； UniProt 3–69

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1cpz
沉积日期 deposition_date	1999-05-06
结构标题 title	COPPER CHAPERONE OF ENTEROCOCCUS HIRAE (APO-FORM)
关键词 keywords	COPPER CHAPERONE, METAL TRANSPORT, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	11.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	11.04 Å
零角强度 I(0) i0	312765000.00
分子量 molecular_weight	148970.0 kDa
排除体积 excluded_volume	186830 Å³
包络体积 envelope_volume	15109 Å³
水化壳体积 shell_volume	10446 Å³
包络直径 envelope_diameter	40.8 Å
壳层 Rg shell_rg	18.06 Å
包络 Rg envelope_rg	12.63 Å
形状 Rg shape_rg	11.00 Å
总 Rg total_rg	11.35 Å
总原子数 total_atoms	21180
残基数 n_residues	1360
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	35.5 Å
Rg (实空间) rg_real	11.26 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.27 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1280e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5020e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	11.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	312800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7844
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	14.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.138
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.173
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	148900.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.737; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1cpza_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.17 — HMA, heavy metal-associated domain
家族 Family family	d.58.17.1 — HMA, heavy metal-associated domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1cpzA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	Copper chaperone
分子量 formula_weight	7475.7 kDa
突变 mutation	N-TERMINUS CHANGED FROM MKQ TO AQ
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	21180

来源生物 organism	Enterococcus hirae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1354
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

COPPER CHAPERONE OF ENTEROCOCCUS HIRAE (APO-FORM)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Copper chaperone

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/cp/1cpz/1cpz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cp/1cpz/1cpz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cp/1cpz/1cpz.dat