← 返回搜索
1cwp

STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

物种未注明

UniProt P03601

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 180 RNA 180 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 120 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 60 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 3 RNA 3 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 2 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
3 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 15 RNA 15 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 10 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 5 与全部聚合物一致
4 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 18 RNA 18 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 12 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 6 与全部聚合物一致
5 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 3 RNA 3 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 2 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 1 与全部聚合物一致
6 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 180 RNA 180 ;RNA (5'-R(*AP*UP*AP*U)-3') ; × 120 ;RNA (5'-R(*AP*U)-3') ; × 60 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1za7 1za7 1za7 1za7 1za7 1za7 8c38 8cpy

共 8 个 assembly

异源或核酸复合物
1cwp 1cwp 1cwp 1cwp 1cwp 1cwp

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_CCMV
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–190； UniProt 1–189 作者链 B； PDB构建体 1–190； UniProt 1–189 作者链 C； PDB构建体 1–190； UniProt 1–189

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1cwp
沉积日期 deposition_date1995-05-22
结构标题 titleSTRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY
关键词 keywordsBROMOVIRUS, Icosahedral virus, Virus-RNA COMPLEX; Virus/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1cwp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1cwp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1cwp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）118.30 Å
总 Rg118.30 Å
原子数227040
残基数29220
排除体积4041100 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1cwp__assembly_1__model_1 360-MERIC （360） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1cwp__assembly_2__model_1 hexameric （6） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1cwp__assembly_3__model_1 30-meric （30） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1cwp__assembly_4__model_1 36-meric （36） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1cwp__assembly_5__model_1 hexameric （6） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 1cwp__assembly_6__model_1 360-meric （360） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1cwpa_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.5 — Bromoviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cwpb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.5 — Bromoviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cwpc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.5 — Bromoviridae-like VP

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1cwpA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220 — Satellite virus coat domain
结构域编号 domain_id1cwpB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220 — Satellite virus coat domain
结构域编号 domain_id1cwpC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220 — Satellite virus coat domain
▶

7. 引用文献 (4)