1d2z

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE DEATH DOMAINS OF PELLE AND TUBE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DEATH DOMAIN OF PELLE

Drosophila melanogaster

UniProt Q05652

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DEATH DOMAIN OF TUBE × 1 (P22812) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DEATH DOMAIN OF TUBE × 1 (P22812) 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KPEL_DROME
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–108; UniProt 26–129 作者链 C; PDB构建体 1–108; UniProt 26–129

DEATH DOMAIN OF TUBE

Drosophila melanogaster

UniProt P22812

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DEATH DOMAIN OF PELLE × 1 (Q05652) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 DEATH DOMAIN OF PELLE × 1 (Q05652) 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TUBE_DROME
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–153; UniProt 23–175 作者链 D; PDB构建体 1–153; UniProt 23–175

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1d2z
沉积日期 deposition_date1999-09-28
结构标题 titleTHREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THE DEATH DOMAINS OF PELLE AND TUBE
关键词 keywordsSIX-HELIX BUNDLE, LINEAR ARRAY OF DEATH DOMAINS, PLASTIC INTERFACES, APOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1d2z__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1d2z__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1d2z__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.86 Å
Rg(电子密度)19.90 Å
总 Rg20.87 Å
原子数2087
残基数261
排除体积37303 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1d2z__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1d2z__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1d2za_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.77 — DEATH domain
超家族 Superfamily superfamilya.77.1 — DEATH domain
家族 Family familya.77.1.2 — DEATH domain, DD
结构域编号 domain_idd1d2zb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.77 — DEATH domain
超家族 Superfamily superfamilya.77.1 — DEATH domain
家族 Family familya.77.1.2 — DEATH domain, DD
结构域编号 domain_idd1d2zc1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.77 — DEATH domain
超家族 Superfamily superfamilya.77.1 — DEATH domain
家族 Family familya.77.1.2 — DEATH domain, DD
结构域编号 domain_idd1d2zc2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1d2zd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.77 — DEATH domain
超家族 Superfamily superfamilya.77.1 — DEATH domain
家族 Family familya.77.1.2 — DEATH domain, DD

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1d2zA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
结构域编号 domain_id1d2zB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
结构域编号 domain_id1d2zC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
结构域编号 domain_id1d2zD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology533 — Death Domain, Fas
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Death Domain, Fas
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7. 引用文献 (1)