1dev

CRYSTAL STRUCTURE OF SMAD2 MH2 DOMAIN BOUND TO THE SMAD-BINDING DOMAIN OF SARA

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MAD (mothers against decapentaplegic, Drosophila) homolog 2

Homo sapiens

UniProt Q15796

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Smad anchor for receptor activation × 1 (O95405) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Smad anchor for receptor activation × 1 (O95405) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMAD2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–196; UniProt 261–456 作者链 C; PDB构建体 1–196; UniProt 261–456

Smad anchor for receptor activation

Homo sapiens

UniProt O95405

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MAD (mothers against decapentaplegic, Drosophila) homolog 2 × 1 (Q15796) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 MAD (mothers against decapentaplegic, Drosophila) homolog 2 × 1 (Q15796) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ZFYV9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–41; UniProt 669–709 作者链 D; PDB构建体 1–41; UniProt 669–709

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dev
沉积日期 deposition_date1999-11-15
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF SMAD2 MH2 DOMAIN BOUND TO THE SMAD-BINDING DOMAIN OF SARA
关键词 keywordsBETA SHEET, THREE-HELIX BUNDLE, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dev__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dev__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dev__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.83 Å
Rg(电子密度)17.81 Å
总 Rg18.79 Å
原子数1838
残基数235
排除体积32525 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dev__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1dev__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1deva_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamilyb.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family familyb.26.1.1 — SMAD domain
结构域编号 domain_idd1devb_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.64 — Smad-binding domain of Sara
超家族 Superfamily superfamilyj.64.1 — Smad-binding domain of Sara
家族 Family familyj.64.1.1 — Smad-binding domain of Sara
结构域编号 domain_idd1devc_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamilyb.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family familyb.26.1.1 — SMAD domain
结构域编号 domain_idd1devd_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.64 — Smad-binding domain of Sara
超家族 Superfamily superfamilyj.64.1 — Smad-binding domain of Sara
家族 Family familyj.64.1.1 — Smad-binding domain of Sara

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1devA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1devB00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology720 — Smad Anchor For Receptor Activation; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Smad anchor for receptor activation, Smad-binding domain
结构域编号 domain_id1devC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
▶

7. 引用文献 (1)