1dhk

STRUCTURE OF PORCINE PANCREATIC ALPHA-AMYLASE

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PORCINE PANCREATIC ALPHA-AMYLASE

物种未注明

UniProt P00690

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 4 其他聚合物 4 BEAN LECTIN-LIKE INHIBITOR × 2 (P02873) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CALCIUM ION × 6 CHLORIDE ION × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AMYP_PIG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–496; UniProt 2–496

BEAN LECTIN-LIKE INHIBITOR

物种未注明

UniProt P02873

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 4 其他聚合物 4 PORCINE PANCREATIC ALPHA-AMYLASE × 2 (P00690) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CALCIUM ION × 6 CHLORIDE ION × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LEA1_PHAVU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–223; UniProt 24–246

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dhk
沉积日期 deposition_date1996-10-14
结构标题 titleSTRUCTURE OF PORCINE PANCREATIC ALPHA-AMYLASE
关键词 keywordsPANCREATIC ALPHA-AMYLASE, PORCINE, LECTIN-LIKE INHIBITOR, COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR), COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR) complex; COMPLEX (HYDROLASE/INHIBITOR)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dhk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dhk__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dhk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)38.78 Å
Rg(电子密度)37.91 Å
总 Rg38.49 Å
原子数13492
残基数1380
排除体积193110 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dhk__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1dhka1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.71 — Glycosyl hydrolase domain
超家族 Superfamily superfamilyb.71.1 — Glycosyl hydrolase domain
家族 Family familyb.71.1.1 — alpha-Amylases, C-terminal beta-sheet domain
结构域编号 domain_idd1dhka2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.8 — (Trans)glycosidases
家族 Family familyc.1.8.1 — Amylase, catalytic domain
结构域编号 domain_idd1dhkb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamilyb.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family familyb.29.1.1 — Legume lectins

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1dhkA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Glycosidases
结构域编号 domain_id1dhkA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1180 — Golgi alpha-mannosidase II
结构域编号 domain_id1dhkB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily200 —
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7. 引用文献 (4)