1dlc

CRYSTAL STRUCTURE OF INSECTICIDAL DELTA-ENDOTOXIN FROM BACILLUS THURINGIENSIS AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DELTA-ENDOTOXIN CRYIIIA

Bacillus thuringiensis

UniProt P0A379

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CR3AA_BACTT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–584; UniProt 61–644

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dlc
沉积日期 deposition_date1994-06-22
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF INSECTICIDAL DELTA-ENDOTOXIN FROM BACILLUS THURINGIENSIS AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION
关键词 keywordsTOXIN; TOXIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dlc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dlc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dlc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.75 Å
Rg(电子密度)25.56 Å
总 Rg26.29 Å
原子数4690
残基数584
排除体积83080 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dlc__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1dlca1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.18 — Galactose-binding domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.18.1 — Galactose-binding domain-like
家族 Family familyb.18.1.3 — delta-Endotoxin, C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1dlca2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.2 — delta-Endotoxin (insectocide), middle domain
家族 Family familyb.77.2.1 — delta-Endotoxin (insectocide), middle domain
结构域编号 domain_idd1dlca3
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.3 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
家族 Family familyf.1.3.1 — delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1dlcA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1dlcA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Galactose-binding domain-like
结构域编号 domain_id1dlcA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Pesticidal crystal protein, central domain

7. 引用文献 (2)