物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*CP*GP*(BRU)P*TP*AP*CP*CP*AP*(BRU)P*GP*GP*TP*AP*AP*CP*G)-3') ; × 2 1,2-ETHANEDIOL × 4 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | RFX1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 P； PDB构建体 1–76； UniProt 438–513 |
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| 条目编号 entry_id | 1dp7 |
| 沉积日期 deposition_date | 1999-12-23 |
| 结构标题 title | COCRYSTAL STRUCTURE OF RFX-DBD IN COMPLEX WITH ITS COGNATE X-BOX BINDING SITE |
| 关键词 keywords | ;WINGED HELIX, MHC CLASS II TRANSCRIPTION FACTOR, PROTEIN-DNA COCRYSTAL STRUCTURE, NOVEL MODE OF DNA RECOGNITION, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX ;; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 20.14 Å |
| Rg（电子密度） | 20.26 Å |
| 总 Rg | 20.78 Å |
| 原子数 | 1928 |
| 残基数 | 180 |
| 排除体积 | 32274 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1dp7p_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.4.5.20 — P4 origin-binding domain-like |
| 结构域编号 domain_id | 1dp7P00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |