1ds5

DIMERIC CRYSTAL STRUCTURE OF THE ALPHA SUBUNIT IN COMPLEX WITH TWO BETA PEPTIDES MIMICKING THE ARCHITECTURE OF THE TETRAMERIC PROTEIN KINASE CK2 HOLOENZYME.

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 104.4 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CASEIN KINASE, ALPHA CHAIN

Zea mays

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–332 链 B； UniProt 1–332	未记录	CASEIN KINASE, BETA CHAIN × 2 （P67870） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；PEG 4000, sodium acetate, tris-HCl, magnesium chloride, ATP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.16 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–332 链 D； UniProt 1–332	未记录	CASEIN KINASE, BETA CHAIN × 2 （P67870） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；PEG 4000, sodium acetate, tris-HCl, magnesium chloride, ATP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.16 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1DS5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DAW CRYSTAL STRUCTURE OF A BINARY COMPLEX OF PROTEIN KINASE CK2 (ALPHA-SUBUNIT) AND MG-AMPPNP 提交 1999-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：CATALYTIC SUBUNIT	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；PEG 3350, SODIUM ACETATE, TRIS/HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
1DAY CRYSTAL STRUCTURE OF A BINARY COMPLEX OF PROTEIN KINASE CK2 (ALPHA-SUBUNIT) AND MG-GMPPNP 提交 1999-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：CATALYTIC SUBUNIT	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；PEG 3350, SODIUM ACETATE, TRIS/HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.290
1F0Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE ALPHA SUBUNIT OF PROTEIN KINASE CK2 IN COMPLEX WITH THE NUCLEOTIDE COMPETITIVE INHIBITOR EMODIN 提交 2000-05-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	EMO 3-METHYL-1,6,8-TRIHYDROXYANTHRAQUINONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；PEG 4000, sodium acetate, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.63 Å R-free 0.273
1J91 Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the ATP-competitive inhibitor 4,5,6,7-tetrabromobenzotriazole 提交 2001-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	TBS 4,5,6,7-TETRABROMOBENZOTRIAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 4000, sodium acetate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.268
1J91 Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the ATP-competitive inhibitor 4,5,6,7-tetrabromobenzotriazole 提交 2001-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–332（332 aa）	未记录	TBS 4,5,6,7-TETRABROMOBENZOTRIAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 4000, sodium acetate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.22 Å R-free 0.268
1JAM Crystal structure of apo-form of Z. Mays CK2 protein kinase alpha subunit 提交 2001-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；287 K；30% PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 100 mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 287K	分辨率 2.18 Å R-free 0.248
1LP4 Crystal structure of a binary complex of the catalytic subunit of protein kinase CK2 with Mg-AMPPNP 提交 2002-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；PEG3350, SODIUM ACETATE, TRIS/HCL, pH 8.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.244
1LPU Low Temperature Crystal Structure of the Apo-form of the catalytic subunit of protein kinase CK2 from Zea mays 提交 2002-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；PEG3350, Tris/HCl, sodium acetate, pH 8.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.248
1LR4 Room Temperature Crystal Structure of the Apo-form of the catalytic subunit of protein kinase CK2 from Zea mays 提交 2002-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, sodium acetate, Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
1M2P Crystal structure of 1,8-di-hydroxy-4-nitro-anthraquinone/CK2 kinase complex 提交 2002-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–326（325 aa）片段：Catlytic subunit	未记录	HNA 1,8-DI-HYDROXY-4-NITRO-ANTHRAQUINONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
1M2Q Crystal structure of 1,8-di-hydroxy-4-nitro-xanten-9-one/CK2 kinase complex 提交 2002-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：Catlytic subunit	未记录	MNX 1,8-DI-HYDROXY-4-NITRO-XANTHEN-9-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.79 Å R-free 0.232
1M2R Crystal structure of 5,8-di-amino-1,4-di-hydroxy-anthraquinone/CK2 kinase complex 提交 2002-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：catalytic subunit	未记录	MNY 5,8-DI-AMINO-1,4-DIHYDROXY-ANTHRAQUINONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
1OM1 Crystal structure of maize CK2 alpha in complex with IQA 提交 2003-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	IQA (5-OXO-5,6-DIHYDRO-INDOLO[1,2-A]QUINAZOLIN-7-YL)-ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 4000, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.68 Å R-free 0.227
1ZOE Crystal structure of protein kinase CK2 in complex with TBB-derivatives inhibitors 提交 2005-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 K25 4,5,6,7-TETRABROMO-N,N-DIMETHYL-1H-BENZIMIDAZOL-2-AMINE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.77 Å R-free 0.277
1ZOG Crystal structure of protein kinase CK2 in complex with TBB-derivatives 提交 2005-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	K37 4,5,6,7-TETRABROMO-2-(METHYLSULFANYL)-1H-BENZIMIDAZOLE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1ZOH Crystal structure of protein kinase CK2 in complex with TBB-derivatives inhibitors 提交 2005-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 K44 5,6,7,8-TETRABROMO-1-METHYL-2,3-DIHYDRO-1H-IMIDAZO[1,2-A]BENZIMIDAZOLE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, Sodium Acetate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.81 Å R-free 0.221
2OXD Protein kinase CK2 in complex with tetrabromobenzoimidazole K17, K22 and K32 inhibitors 提交 2007-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	K32 4,5,6,7-TETRABROMO-1H,3H-BENZIMIDAZOL-2-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.273
2OXX Protein kinase CK2 in complex with tetrabromobenzoimidazole derivatives K17, K22 and K32 提交 2007-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	K22 4,5,6,7-TETRABROMO-1H,3H-BENZIMIDAZOL-2-THIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.270
2OXY Protein kinase CK2 in complex with tetrabromobenzoimidazole derivatives K17, K22 and K32 提交 2007-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	K17 4,5,6,7-TETRABROMO-BENZIMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.81 Å R-free 0.269
2OXY Protein kinase CK2 in complex with tetrabromobenzoimidazole derivatives K17, K22 and K32 提交 2007-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–332（332 aa）	未记录	K17 4,5,6,7-TETRABROMO-BENZIMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.81 Å R-free 0.269
2PVH Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P19 N,N'-DIPHENYLPYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZINE-2,4-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；18% PEG 4000, 0.20M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.20 Å R-free 0.236
2PVJ Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P44 2-(CYCLOHEXYLMETHYLAMINO)-4-(PHENYLAMINO)PYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZINE-8-CARBONITRILE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；12% PEG 4000, 0.10M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 1.70 Å R-free 0.218
2PVK Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P45 2-(4-CHLOROBENZYLAMINO)-4-(PHENYLAMINO)PYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZINE-8-CARBONITRILE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；14% PEG 4000, 0.20M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 1.90 Å R-free 0.244
2PVL Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P55 2-(4-ETHYLPIPERAZIN-1-YL)-4-(PHENYLAMINO)PYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZINE-8-CARBONITRILE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；14% PEG 4000, 0.20M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 1.90 Å R-free 0.289
2PVM Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P29 4-(2-(1H-IMIDAZOL-4-YL)ETHYLAMINO)-2-(PHENYLAMINO)PYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZINE-8-CARBONITRILE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；12% PEG 4000, 0.10M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
2PVN Structure-Based Design of Pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine Derivatives as Potent Inhibitors of Protein Kinase CK2 提交 2007-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P63 N-(3-(8-CYANO-4-(PHENYLAMINO)PYRAZOLO[1,5-A][1,3,5]TRIAZIN-2-YLAMINO)PHENYL)ACETAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；16% PEG 4000, 0.10M Sodium Acetate, 0.10M TrisHCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.308
2QC6 Protein kinase CK2 in complex with DBC 提交 2007-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G12 3,8-DIBROMO-7-HYDROXY-4-METHYL-2H-CHROMEN-2-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；10-20% PEG4000, 0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Tris, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 1.85 Å R-free 0.268
3BE9 Structure-based design and synthesis of novel macrocyclic pyrazolo[1,5-a] [1,3,5]triazine compounds as potent inhibitors of protein kinase CK2 and their anticancer activities 提交 2007-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	突变：V256A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	P04 19-(cyclopropylamino)-4,6,7,15-tetrahydro-5H-16,1-(azenometheno)-10,14-(metheno)pyrazolo[4,3-o][1,3,9]triazacyclohexadecin-8(9H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；14% PEG 4000, 0.05M Sodium Acetate, 0.10M TRISHCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3FL5 Protein kinase CK2 in complex with the inhibitor Quinalizarin 提交 2008-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TXQ 1,2,5,8-tetrahydroxyanthracene-9,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 4000, 200mM Na-acetate, 100mM Na-HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
3KXG Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the inhibitor 3,4,5,6,7-pentabromo-1H-indazole (K64) 提交 2009-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：ALPHA SUBUNIT	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K6X 3,4,5,6,7-pentabromo-1H-indazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Na-acetate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.263
3KXH Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the inhibitor (2-dymethylammino-4,5,6,7-tetrabromobenzoimidazol-1yl-acetic acid (K66) 提交 2009-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：ALPHA SUBUNIT	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K66 [4,5,6,7-tetrabromo-2-(dimethylamino)-1H-benzimidazol-1-yl]acetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Na-acetate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.266
3KXM Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the inhibitor K74 提交 2009-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：ALPHA SUBUNIT	未记录	K74 N-methyl-2-[(4,5,6,7-tetrabromo-1-methyl-1H-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Na-acetate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.75 Å R-free 0.282
3KXN Crystal structure of Z. mays CK2 kinase alpha subunit in complex with the inhibitor tetraiodobenzimidazole (K88) 提交 2009-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–328（327 aa）片段：ALPHA SUBUNIT	未记录	K8X 4,5,6,7-tetraiodo-1H-benzimidazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Na-acetate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
3PVG Crystal structure of Z. mays CK2 alpha subunit in complex with the inhibitor 4,5,6,7-tetrabromo-1-carboxymethylbenzimidazole (K68) 提交 2010-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–332（331 aa）片段：alpha subunit	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K68 (4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazol-1-yl)acetic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Na-acetate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.211
3PWD Crystal structure of maize CK2 in complex with NBC (Z1) 提交 2010-12-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	CZ0 8-hydroxy-4-methyl-9-nitro-2H-benzo[g]chromen-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M sodium acetate, 0.1M TrisHCl, pH 8, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
3PZH Crystal structure of maize CK2 alpha in complex with emodin at 1.92 A resolution 提交 2010-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EMO 3-METHYL-1,6,8-TRIHYDROXYANTHRAQUINONE × 1 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% PEG 4000, 0.2M sodium acetate, 0.1M TrisHCl, pH 8, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.209
4ANM Complex of CK2 with a CDC7 inhibitor 提交 2012-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–332（331 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 2-332	未记录	WUL 8-BROMANYL-2-[[(3S)-3-OXIDANYLPYRROLIDIN-1-YL]METHYL]-3H-[1]BENZOFURO[3,2-D]PYRIMIDIN-4-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；20% PEG4K, 200 MM NAOAC, 100 MM TRIS, PH 8.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.202
4DGM Crystal Structure of maize CK2 in complex with the inhibitor apigenin 提交 2012-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–327（326 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 AGI 5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-4H-chromen-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris-HCl, 10-20% PEG 4000, 0.2 M Na-acetate, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 1.65 Å R-free 0.252
4DGN Crystal Structure of maize CK2 in complex with the inhibitor luteolin 提交 2012-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–327（326 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	LU2 2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-4H-chromen-4-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris-HCl, 10-20% PEG 4000, 0.2 M Na-acetate, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 1.75 Å R-free 0.214
4RLK Crystal structure of Z. mays CK2alpha in complex with the ATP-competitive inhibitor 4-[(E)-(fluoren-9-ylidenehydrazinylidene)-methyl] benzoate 提交 2014-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–332（332 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 E91 4-[(E)-(9H-fluoren-9-ylidenehydrazinylidene)methyl]benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Reservoir: 20 % PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.24 Å R-free 0.175
6QS5 Crystal Structure of maize CK2 in complex with tyrphostin AG99 提交 2019-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–326（325 aa）	未记录	JGB (~{E})-3-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]-2-cyano-prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris-HCl, 10-20% PEG 4000, 0.2 M Na-acetate	分辨率 1.96 Å R-free 0.219

共 39 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSK2A_MAIZE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–332； UniProt 1–332 作者链 B； PDB构建体 1–332； UniProt 1–332 作者链 C； PDB构建体 1–332； UniProt 1–332 作者链 D； PDB构建体 1–332； UniProt 1–332

CASEIN KINASE, BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P67870

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 181–203 链 F； UniProt 181–203	片段：RESIDUES 181-203	CASEIN KINASE, ALPHA CHAIN × 2 （P28523） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；PEG 4000, sodium acetate, tris-HCl, magnesium chloride, ATP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.16 Å R-free 0.289
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 181–203 链 H； UniProt 181–203	片段：RESIDUES 181-203	CASEIN KINASE, ALPHA CHAIN × 2 （P28523） AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；PEG 4000, sodium acetate, tris-HCl, magnesium chloride, ATP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.16 Å R-free 0.289

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1DS5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JWH Crystal Structure of Human Protein Kinase CK2 Holoenzyme 提交 2001-09-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–215（215 aa）链 D 1–215（215 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 7 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.3；285 K；initial composition of the drop: 3 ul rhCK2 stock solution [5 mg/ml enzyme in 25 mM Tris/HCl, 300 mM NaCl, 1 mM dithiothreitole, pH 8.5], 1.5 ul reservoir solution [20 % (w/v) PEG3350, 200 mM dipotassium hydrogenphosphate], 3 ul 1 mM adenylyl imidodiphosphate (AMPPNP), 3 ul 2 mM magnesium chloride, 2 ul 10 % (w/v) polyethylene glycol 400 dodecylether (Thesit), pH 9.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 285K	分辨率 3.10 Å R-free 0.338
1QF8 TRUNCATED FORM OF CASEIN KINASE II BETA SUBUNIT (2-182) FROM HOMO SAPIENS 提交 1999-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–182（182 aa）片段：BETA SUBUNIT (RESIDUES 1-182) 链 B 1–182（182 aa）片段：BETA SUBUNIT (RESIDUES 1-182)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；281 K；CRYSTALS OF CK2 BETA (1-182) WERE GROWN AT 281 K IN 4 MICROLITER SITTING DROPS CONTAINING A 1:1 MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION (18 MG/ML) IN 10 MM TRIS (PH 7) AND RESERVOIR SOLUTION WITH 15% PEG 5K MME, 500 MM NACL, 460 MM MGCL2 3% DIOXANE, pH 9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 1.74 Å R-free 0.219
3EED Crystal structure of human protein kinase CK2 regulatory subunit (CK2beta; mutant 1-193) 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–193（193 aa）片段：regulatory subunit, UNP residues 1-193 链 B 1–193（193 aa）片段：regulatory subunit, UNP residues 1-193	未记录	ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；25.5% PEG 8000, 15% glycerol, 0.17M ammonium sulfate, 0.085M sodium cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.216
3EED Crystal structure of human protein kinase CK2 regulatory subunit (CK2beta; mutant 1-193) 提交 2008-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–193（193 aa）片段：regulatory subunit, UNP residues 1-193 链 B 1–193（193 aa）片段：regulatory subunit, UNP residues 1-193	未记录	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；25.5% PEG 8000, 15% glycerol, 0.17M ammonium sulfate, 0.085M sodium cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.216
4DGL Crystal Structure of the CK2 Tetrameric Holoenzyme 提交 2012-01-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–215（215 aa）链 B 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；PEG 3350 18%, 0.2 M sodium malonate, pH 7, vapor diffusion, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.222
4MD7 Crystal Structure of full-length symmetric CK2 holoenzyme 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–215（215 aa）链 B 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
4MD7 Crystal Structure of full-length symmetric CK2 holoenzyme 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–215（215 aa）链 D 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.263
4MD8 Crystal Structure of full-length symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–215（215 aa）链 B 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
4MD8 Crystal Structure of full-length symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–215（215 aa）链 D 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.30 Å R-free 0.249
4MD9 Crystal Structure of symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E truncated at aa 336) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–215（215 aa）链 B 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.259
4MD9 Crystal Structure of symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E truncated at aa 336) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–215（215 aa）链 D 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.259
4MD9 Crystal Structure of symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E truncated at aa 336) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 1–215（215 aa）链 O 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.259
4MD9 Crystal Structure of symmetric CK2 holoenzyme with mutated alpha subunit (F121E truncated at aa 336) 提交 2013-08-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–215（215 aa）链 J 1–215（215 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.259
4NH1 Crystal structure of a heterotetrameric CK2 holoenzyme complex carrying the Andante-mutation in CK2beta and consistent with proposed models of autoinhibition and trans-autophosphorylation 提交 2013-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–215（215 aa）链 D 1–215（215 aa）	突变：Met166Ile 突变：Met166Ile	MG MAGNESIUM ION × 4 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å R-free 0.251

共 8 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSK2B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–23； UniProt 181–203 作者链 F； PDB构建体 1–23； UniProt 181–203 作者链 G； PDB构建体 1–23； UniProt 181–203 作者链 H； PDB构建体 1–23； UniProt 181–203

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ds5
沉积日期 deposition_date	2000-01-07
结构标题 title	DIMERIC CRYSTAL STRUCTURE OF THE ALPHA SUBUNIT IN COMPLEX WITH TWO BETA PEPTIDES MIMICKING THE ARCHITECTURE OF THE TETRAMERIC PROTEIN KINASE CK2 HOLOENZYME.
关键词 keywords	protein-complex, tetramer, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.02 Å
零角强度 I(0) i0	396503000.00
分子量 molecular_weight	164310.0 kDa
排除体积 excluded_volume	207150 Å³
包络体积 envelope_volume	260000 Å³
水化壳体积 shell_volume	61446 Å³
包络直径 envelope_diameter	108.8 Å
壳层 Rg shell_rg	42.61 Å
包络 Rg envelope_rg	32.96 Å
形状 Rg shape_rg	34.03 Å
总 Rg total_rg	34.62 Å
总原子数 total_atoms	11595
残基数 n_residues	1378
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	104.4 Å
Rg (实空间) rg_real	34.82 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.9650e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3230e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.98 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	396600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9039
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	46.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.028
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.574
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	82150000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.948; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.969; Smooth: 0.934

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CASEIN KINASE, ALPHA CHAIN
分子量 formula_weight	39291.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.37
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11932

MSKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENSRTRA

来源 Source

来源生物 organism	Zea mays
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4577
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CASEIN KINASE, BETA CHAIN
分子量 formula_weight	2766.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.37
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

NQFVPRLYGFKIHPMAYQLQLQA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE MONOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	347.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	337

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1ds5a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	d1ds5b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	d1ds5c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	d1ds5d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1ds5A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	1ds5D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	87.681 Å
晶胞边长 b length_b	119.846 Å
晶胞边长 c length_c	145.560 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.160 Å
最低分辨率 resolution_low	45.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2140
R_free r_free	0.2890

fit	/app/data/saxs_computation/ds/1ds5/1ds5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ds/1ds5/1ds5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ds/1ds5/1ds5.dat

DIMERIC CRYSTAL STRUCTURE OF THE ALPHA SUBUNIT IN COMPLEX WITH TWO BETA PEPTIDES MIMICKING THE ARCHITECTURE OF THE TETRAMERIC PROTEIN KINASE CK2 HOLOENZYME.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CASEIN KINASE, ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CASEIN KINASE, BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)