SAXSdb — 1e18

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DMSO REDUCTASE.

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE × 2 OXO-TUNGSTEN(VI) × 1 ETHANOL × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DMSA_RHOCA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1e18
沉积日期 deposition_date	2000-04-28
结构标题 title	TUNGSTEN-SUSBSTITUTED DMSO REDUCTASE FROM RHODOBACTER CAPSULATUS
关键词 keywords	OXIDOREDUCTASE, REDUCTASE, DMSO, MOLYBDOPTERIN, MOLYBDENUM, TUNGSTEN; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1e18__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1e18__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1e18__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.67 Å
Rg（电子密度）	25.87 Å
总 Rg	26.71 Å
原子数	6081
残基数	779
排除体积	107380 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1e18__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DMSO REDUCTASE.
分子量 formula_weight	89583.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6475

MTKFSGNELRAELYRRAFLSYSVAPGALGMFGRSLLAKGARAEALANGTVMSGSHWGVFTATVENGRATAFTPWEKDPHPSPMLAGVLDSIYSPTRIKYPMVRREFLEKGVNADRSTRGNGDFVRVSWDQALDLVAAEVKRVEETYGPQGVFGGSYGWKSPGRLHNCTTLLRRMLTLAGGYVNGAGDYSTGAAQVIMPHVVGTLEVYEQQTAWPVLAENTEVMVFWAADPIKTSQIGWVIPEHGAYPGLEALKAKGTKVIVIDPVRTKTVEFFGAEHITPKPQTDVAIMLGMAHTLVAEDLYDKDFIANYTSGFDKFLPYLDGETDSTPKTAEWAEGISGVPAETIKELARLFESKRTMLAAGWSMQRMHHGEQAHWMLVTLASMLGQIGLPGGGFGLSYHYSGGGTPSTSGPALAGITDGGAATKGPEWLAASGASVIPVARVVDMLENPGAEFDFNGTRSKFPDVKMAYWVGGNPFVHHQDRNRMVKAWEKLETFVVHDFQWTPTARHADIVLPATTSYERNDIETIGDYSNTGILAMKKIVEPLYEARSDYDIFAAVAERLGKGKEFTEGKDEMGWIKSFYDDAAKQGKAAGVEMPAFDAFWAEGIVEFPVTDGADFVRYASFREDPLLNPLGTPTGLIEIYSKNIEKMGYDDCPAHPTWMEPLERLDGPGAKYPLHIAASHPFNRLHSQLNGTVLREGYAVQGHEPCLMHPDDAAARGIADGDVVRVHNDRGQILTGVKVTDAVMKGVIQIYEGGWYDPSDVTEPGTLDKYGDVNVLSADIGTSKLAQGNCGQTVLAEVEKYTGPAVTLTGFVAPKAAE

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	2-AMINO-5,6-DIMERCAPTO-7-METHYL-3,7,8A,9-TETRAHYDRO-8-OXA-1,3,9,10-TETRAAZA-ANTHRACEN-4-ONE GUANOSINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	738.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	OXO-TUNGSTEN(VI)
分子量 formula_weight	199.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ETHANOL
分子量 formula_weight	46.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	394

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1e18a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.52 — Double psi beta-barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.52.2 — ADC-like
家族 Family family	b.52.2.2 — Formate dehydrogenase/DMSO reductase, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1e18a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.81 — Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3
超家族 Superfamily superfamily	c.81.1 — Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3
家族 Family family	c.81.1.1 — Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1e18A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	740 —

结构域编号 domain_id	1e18A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	228 — Dimethylsulfoxide Reductase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dimethylsulfoxide Reductase, domain 2

结构域编号 domain_id	1e18A03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	55 — Dimethylsulfoxide Reductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dimethylsulfoxide Reductase, domain 3

结构域编号 domain_id	1e18A04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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晶胞边长 a length_a	80.920 Å
晶胞边长 b length_b	80.920 Å
晶胞边长 c length_c	229.780 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1420
R_free r_free	0.1920

TUNGSTEN-SUSBSTITUTED DMSO REDUCTASE FROM RHODOBACTER CAPSULATUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DMSO REDUCTASE.

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1e18__assembly_1__model_1

1e18__assembly_1__model_1 | I(q)

1e18__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

TUNGSTEN-SUSBSTITUTED DMSO REDUCTASE FROM RHODOBACTER CAPSULATUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DMSO REDUCTASE.

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1e18__assembly_1__model_1

1e18__assembly_1__model_1 | I(q)

1e18__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)