D-AMINOPEPTIDASE
Ochrobactrum anthropi
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | Q9ZBA9_OCHAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–520； UniProt 1–520 |
1ei5
CRYSTAL STRUCTURE OF A D-AMINOPEPTIDASE FROM OCHROBACTRUM ANTHROPI
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1ei5 |
| 沉积日期 deposition_date | 2000-02-24 |
| 结构标题 title | CRYSTAL STRUCTURE OF A D-AMINOPEPTIDASE FROM OCHROBACTRUM ANTHROPI |
| 关键词 keywords | D-AMINOPEPTIDASE, PENICILLIN BINDING PROTEIN, ALPHA/BETA DOMAIN, BETA BARREL DOMAIN, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1ei5__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1ei5__assembly_1__model_1 | I(q)
1ei5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 31.73 Å |
| Rg（电子密度） | 30.73 Å |
| 总 Rg | 31.39 Å |
| 原子数 | 7922 |
| 残基数 | 1036 |
| 排除体积 | 139680 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains
SCOP 2.08 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1ei5a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.61 — Streptavidin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.61.3 — D-aminopeptidase, middle and C-terminal domains |
| 家族 Family family | b.61.3.1 — D-aminopeptidase, middle and C-terminal domains |
| 结构域编号 domain_id | d1ei5a2 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.61 — Streptavidin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.61.3 — D-aminopeptidase, middle and C-terminal domains |
| 家族 Family family | b.61.3.1 — D-aminopeptidase, middle and C-terminal domains |
| 结构域编号 domain_id | d1ei5a3 |
| 类 Class class | e — Multi-domain proteins (alpha and beta) |
| 折叠类型 Fold fold | e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like |
| 家族 Family family | e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase |
CATH v4.4 (3 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1ei5A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 710 — Beta-lactamase |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily |
| 结构域编号 domain_id | 1ei5A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 128 — Lipocalin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 50 — |
| 结构域编号 domain_id | 1ei5A03 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 128 — Lipocalin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 50 — |