1ej5

SOLUTION STRUCTURE OF THE AUTOINHIBITED CONFORMATION OF WASP

Method: SOLUTION NMR Dmax: 43.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN

Homo sapiens

UniProt P42768

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 242–310 链 A; UniProt 461–492 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75mM;压力 ambient NMR测量条件:pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75mM;压力 ambient NMR测量条件:pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75mM;压力 ambient NMR测量条件:pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75mM;压力 ambient NMR样品组成:1.6 mM protein U-15N; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:1.6 mM protein U-15N,13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:1.6 mM protein U-15N, 10% 13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成:1.6 mM protein U-15N,13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 100% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WASP_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–69; UniProt 242–310 作者链 A; PDB构建体 76–107; UniProt 461–492

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1ej5

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1ej5
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ej5
沉积日期 deposition_date2000-02-29
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF THE AUTOINHIBITED CONFORMATION OF WASP
关键词 keywordsalpha helix, beta-hairpin turn, BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier16.15
回转半径 Rg (电子) rg_electron15.26
零角强度 I(0) i0927523000.00
分子量 molecular_weight231650.0 kDa
排除体积 excluded_volume279860 ų
包络体积 envelope_volume64440 ų
水化壳体积 shell_volume24780 ų
包络直径 envelope_diameter90.1
壳层 Rg shell_rg28.83
包络 Rg envelope_rg22.27
形状 Rg shape_rg15.27
总 Rg total_rg15.63
总原子数 total_atoms31640
残基数 n_residues2140
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax43.5
Rg (实空间) rg_real15.12
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.07
I(0) (实空间) i0_real8.8030e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.1420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal16.29
I(0) (倒空间) i0_reciprocal927500000.0000
解质量估计 total_estimate0.6774
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary18.2
偏度 Skewness skewness0.351
峰度 Kurtosis kurtosis-0.263
角度范围 angular_range— – 0.4950 −1
当前正则化参数 α current_alpha3.0690
最高正则化参数 α highest_alpha2690000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.012; Oscil: 0.949; Stabil: 0.988; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ej5a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.68 — Wiscott-Aldrich syndrome protein, WASP, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilya.68.1 — Wiscott-Aldrich syndrome protein, WASP, C-terminal domain
家族 Family familya.68.1.1 — Wiscott-Aldrich syndrome protein, WASP, C-terminal domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1ej5A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology810 — SerineThreonine-protein kinase PAK-alpha; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CRIB domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)