1exy

SOLUTION STRUCTURE OF HTLV-1 PEPTIDE BOUND TO ITS RNA APTAMER TARGET

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTLV-1 REX PEPTIDE

物种未注明

UniProt O56230

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 1 RNA APTAMER, 33-MER × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O56230_9DELA
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–16; UniProt 1–16

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1exy
沉积日期 deposition_date2000-05-05
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF HTLV-1 PEPTIDE BOUND TO ITS RNA APTAMER TARGET
关键词 keywords;arginine-guanine sandwich, extended bound basic Rex peptide, flap base, junctional base triplets, RNA binding pocket architecture, RNA BINDING PROTEIN-RNA COMPLEX ;; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1exy__assembly_1__model_7

Assembly 1 · Model 7 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1exy__assembly_1__model_7 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1exy__assembly_1__model_7 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.69 Å
Rg(电子密度)14.10 Å
总 Rg14.90 Å
原子数1382
残基数49
排除体积12537 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1exy__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1exy__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1exy__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1exy__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1exy__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1exy__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1exy__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1exy__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1exy__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1exy__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1exy__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1exy__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1exyb_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.9 — Arg-rich RNA binding peptides
超家族 Superfamily superfamilyj.9.6 — HTLV-1 peptide
家族 Family familyj.9.6.1 — HTLV-1 peptide

7. 引用文献 (1)