1f51

A TRANSIENT INTERACTION BETWEEN TWO PHOSPHORELAY PROTEINS TRAPPED IN A CRYSTAL LATTICE REVEALS THE MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION AND PHOSPHOTRANSFER IN SINGAL TRANSDUCTION

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B

Bacillus subtilis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F × 2 （P06628） MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F × 2 （P06628） MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SP0B_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–182； UniProt 11–192 作者链 B； PDB构建体 1–182； UniProt 11–192 作者链 C； PDB构建体 1–182； UniProt 11–192 作者链 D； PDB构建体 1–182； UniProt 11–192

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F

Bacillus subtilis

UniProt P06628

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B × 2 （P06535） MAGNESIUM ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B × 2 （P06535） MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SP0F_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–119； UniProt 3–121 作者链 F； PDB构建体 1–119； UniProt 3–121 作者链 G； PDB构建体 1–119； UniProt 3–121 作者链 H； PDB构建体 1–119； UniProt 3–121

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1f51
沉积日期 deposition_date	2000-06-11
结构标题 title	A TRANSIENT INTERACTION BETWEEN TWO PHOSPHORELAY PROTEINS TRAPPED IN A CRYSTAL LATTICE REVEALS THE MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION AND PHOSPHOTRANSFER IN SINGAL TRANSDUCTION
关键词 keywords	TWO COMPONENT SYSTEM, SINGAL TRANDUCTION, RESPONSE REGULATOR, PHOSPHOTRANSFERASE, SPORULATION, PHOSPHORELAY, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1f51__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1f51__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1f51__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.31 Å
Rg（电子密度）	27.20 Å
总 Rg	28.00 Å
原子数	4866
残基数	601
排除体积	87099 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1f51__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1f51__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B
分子量 formula_weight	21382.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	9751

NISDTALTNELIHLLGHSRHDWMNKLQLIKGNLSLQKYDRVFEMIEEMVIDAKHESKLSNLKTPHLAFDFLTFNWKTHYMTLEYEVLGEIKDLSAYDQKLAKLMRKLFHLFDQAVSRESENHLTVSLQTDHPDRQLILYLDFHGAFADPSAFDDIRQNGYEDVDIMRFEITSHECLIEIGLD

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F
分子量 formula_weight	13575.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

NEKILIVDDQSGIRILLNEVFNKEGYQTFQAANGLQALDIVTKERPDLVLLDMKIPGMDGIEILKRMKVIDENIRVIIMTAYGELDMIQESKELGALTHFAKPFDIDEIRDAVKKYLPL

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1f51a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.123 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
超家族 Superfamily superfamily	d.123.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
家族 Family family	d.123.1.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B

结构域编号 domain_id	d1f51b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.123 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
超家族 Superfamily superfamily	d.123.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
家族 Family family	d.123.1.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B

结构域编号 domain_id	d1f51c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.123 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
超家族 Superfamily superfamily	d.123.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
家族 Family family	d.123.1.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B

结构域编号 domain_id	d1f51d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.123 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
超家族 Superfamily superfamily	d.123.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B
家族 Family family	d.123.1.1 — Sporulation response regulatory protein Spo0B

结构域编号 domain_id	d1f51e_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.1 — CheY-like
家族 Family family	c.23.1.1 — CheY-related

结构域编号 domain_id	d1f51f_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.1 — CheY-like
家族 Family family	c.23.1.1 — CheY-related

结构域编号 domain_id	d1f51g_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.1 — CheY-like
家族 Family family	c.23.1.1 — CheY-related

结构域编号 domain_id	d1f51h_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.1 — CheY-like
家族 Family family	c.23.1.1 — CheY-related

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	1f51A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain

结构域编号 domain_id	1f51A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Sporulation initiation phosphotransferase B (SpoOB), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1f51B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain

结构域编号 domain_id	1f51B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Sporulation initiation phosphotransferase B (SpoOB), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1f51C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain

结构域编号 domain_id	1f51C02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Sporulation initiation phosphotransferase B (SpoOB), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1f51D01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	130 — Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphotransfer (DHp) domain

结构域编号 domain_id	1f51D02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	565 — Heat Shock Protein 90
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Sporulation initiation phosphotransferase B (SpoOB), C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1f51E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	1f51F00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	1f51G00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

结构域编号 domain_id	1f51H00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2300 — Response regulator

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晶胞边长 a length_a	72.974 Å
晶胞边长 b length_b	117.774 Å
晶胞边长 c length_c	170.736 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	45.000 Å
R 因子 r_factor	0.2290
R_work r_work	0.2280
R_free r_free	0.2680

A TRANSIENT INTERACTION BETWEEN TWO PHOSPHORELAY PROTEINS TRAPPED IN A CRYSTAL LATTICE REVEALS THE MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION AND PHOSPHOTRANSFER IN SINGAL TRANSDUCTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1f51__assembly_2__model_1

1f51__assembly_2__model_1 | I(q)

1f51__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

A TRANSIENT INTERACTION BETWEEN TWO PHOSPHORELAY PROTEINS TRAPPED IN A CRYSTAL LATTICE REVEALS THE MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION AND PHOSPHOTRANSFER IN SINGAL TRANSDUCTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SPORULATION INITIATION PHOSPHOTRANSFERASE F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1f51__assembly_2__model_1

1f51__assembly_2__model_1 | I(q)

1f51__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 20 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)