1fd3

HUMAN BETA-DEFENSIN 2

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA-DEFENSIN 2

物种未注明

UniProt O15263

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 SULFATE ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BD02_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–41; UniProt 24–64 作者链 B; PDB构建体 1–41; UniProt 24–64 作者链 C; PDB构建体 1–41; UniProt 24–64 作者链 D; PDB构建体 1–41; UniProt 24–64

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1fd3
沉积日期 deposition_date2000-07-19
结构标题 titleHUMAN BETA-DEFENSIN 2
关键词 keywordsDEFENSIN, HUMAN BETA-DEFENSIN 2, BETA-DEFENSIN, ANTIMICROBIAL PROTEIN; ANTIMICROBIAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fd3__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fd3__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fd3__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)13.68 Å
Rg(电子密度)13.22 Å
总 Rg14.16 Å
原子数595
残基数81
排除体积10779 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1fd3__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1fd3__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1fd3a_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin
结构域编号 domain_idd1fd3b_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin
结构域编号 domain_idd1fd3c_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin
结构域编号 domain_idd1fd3d_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.9 — Defensin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.9.1 — Defensin-like
家族 Family familyg.9.1.1 — Defensin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1fd3A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology360 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
结构域编号 domain_id1fd3B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology360 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
结构域编号 domain_id1fd3C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology360 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
结构域编号 domain_id1fd3D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology360 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Antimicrobial Peptide, Beta-defensin 2; Chain A

7. 引用文献 (1)