COPPER TRANSPORT PROTEIN ATOX1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–68 链 B; UniProt 1–68 | 未记录 | beta-D-fructofuranose-(2-1)-alpha-D-glucopyranose × 1 IUM URANYL (VI) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 HG MERCURY (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;MES buffer, ammonium sulfate, magnesium chloride, dithiothreitol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K | 分辨率 1.75 Å R-free 0.218 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1FE4 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FE0 CRYSTAL STRUCTURE OF CADMIUM-HAH1 提交 2000-07-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CD CADMIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;MES buffer, lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.213 |
| 1FEE CRYSTAL STRUCTURE OF COPPER-HAH1 提交 2000-07-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Strictly anaerobic.
MES buffer, lithium sulfate, and dithiothreitol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 1TL4 Solution structure of Cu(I) HAH1 提交 2004-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM sodium acetate;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM Cu(I)HAH1 U-15N; 10 mM sodium acetate | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM Cu(I)HAH1 U-95% 13C,U-98% 15N; 4 mM DTT; 100 mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1TL5 Solution structure of apoHAH1 提交 2004-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM apoHAH1 U-15N; 5mM DTT; 100 mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM apoHAH1 U-95% 13C,U-98% 15N; 5 mM DTT; 100 mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM unlabelled apoHAH1 ; 5 mM DTT; 100 mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K1R The solution NMR structure of the complex between MNK1 and HAH1 mediated by Cu(I) 提交 2008-03-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 0.6 mM HAH1, 0.6 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MNK1, 1.0 mM HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM MNK1, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HAH1, 1.0 mM COPPER(I) ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LQ9 Solution structure of the K60A mutant of Atox1 提交 2012-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
突变:K60A | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.215;压力 ambient
NMR样品组成
0.4-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity-1, 100 mM sodium phosphate-2, 2-2.5 mM DTT-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.5 mM [U-100% 15N] entity-4, 100 mM sodium phosphate-5, 2-2.5 mM DTT-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity-7, 100 mM sodium phosphate-8, 2-2.5 mM DTT-9, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3CJK Crystal structure of the adduct HAH1-Cd(II)-MNK1. 提交 2008-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–68(67 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;298 K;0.1 M sodium citrate, 20% PEG-6000, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.283 |
| 3IWL Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) 提交 2009-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.210 |
| 3IWL Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) 提交 2009-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.210 |
| 3IWX Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (dimer) 提交 2009-09-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | CPT Cisplatin × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;1.5 M lithium sulfate, 0.1M MES, 50 mM NaCl, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.228 |
| 4QOT Crystal structure of human copper chaperone bound to the platinum ion 提交 2014-06-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;12mg/mlATOX-Pt(DACH)(H2O)(SO4), 65% sat Li2SO4, 100mM MES, 60mM NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4YDX Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (monomer) - new refinement 提交 2015-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–68(67 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;2M lithium sulfate, 0.1M MES, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.155 |
| 4YEA Crystal structure of cisplatin bound to a human copper chaperone (dimer) - new refinement 提交 2015-02-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–68(67 aa)
链 B
2–68(67 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;294 K;1.5 M LITHIUM SULFATE, 0.1M MES, 50 MM NACL, PH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 294K
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.197 |
| 5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 5F0W Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2015-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M tri-sodium citrate, 20 % (W/V) PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.289 |
| 5T7L Pt(II)-mediated copper-dependent interactions between ATOX1 and MNK1 提交 2016-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–68(67 aa)
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 2 CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG-6000 10 to 30 % w/v and sodium citrate 0.1M at pH 4.7
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.273 |
| 7DC1 Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2020-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M LiCl, 0.1M Tris pH8, 20% PEG6,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 7DC1 Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 提交 2020-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | AG SILVER ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M LiCl, 0.1M Tris pH8, 20% PEG6,000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 7ZC3 Crystal structure of human copper chaperone Atox1 bound to zinc ion by CxxC motif 提交 2022-03-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–68(68 aa)
链 B
1–68(68 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;Drop:12.5mg/ml Atox1 + 1.62mM ZnSO4 in 25mM Sodium Phosphate buffer pH 7.0, 2mM DTT;
Reservoir: 1.9M Li2SO4, 100mM MES pH 6.0, 2.5% glycerol;
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.186 |
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| UniProt名称 | ATOX1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–68; UniProt 1–68 作者链 B; PDB构建体 1–68; UniProt 1–68 |