1flc

X-RAY STRUCTURE OF THE HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN OF INFLUENZA C VIRUS

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN

Influenza C virus (C/Johannesburg/1/66)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 6 其他聚合物 15	HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN × 3 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HEMA_INCJH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–432； UniProt 15–446 作者链 C； PDB构建体 1–432； UniProt 15–446 作者链 E； PDB构建体 1–432； UniProt 15–446

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1flc
沉积日期 deposition_date	1999-02-22
结构标题 title	X-RAY STRUCTURE OF THE HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN OF INFLUENZA C VIRUS
关键词 keywords	ESTERASE, RECEPTOR BINDING, MEMBRANE FUSION, VIRUS, INFLUENZA, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1flc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1flc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1flc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	44.05 Å
Rg（电子密度）	43.86 Å
总 Rg	43.97 Å
原子数	14285
残基数	1767
排除体积	254220 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1flc__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN
分子量 formula_weight	48230.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	14285

EKIKICLQKQVNSSFSLHNGFGGNLYATEEKRMFELVKPKAGASVLNQSTWIGFGDSRTDKSNSAFPRSADVSAKTADKFRFLSGGSLMLSMFGPPGKVDYLYQGCGKHKVFYEGVNWSPHAAINCYRKNWTDIKLNFQKNIYELASQSHCMSLVNALDKTIPLQVTAGTAGNCNNSFLKNPALYTQEVKPSENKCGKENLAFFTLPTQFGTYECKLHLVASCYFIYDSKEVYNKRGCDNYFQVIYDSFGKVVGGLDNRVSPYTGNSGDTPTMQCDMLQLKPGRYSVRSSPRFLLMPERSYCFDMKEKGPVTAVQSIWGKGRESDYAVDQACLSTPGCMLIQKQKPYIGEADDHHGDQEMRELLSGLDYEARCISQSGWVNETSPFTEKYLLPPKFGRCPLAAKEESIPKIPDGLLIPTSGTDTTVTKPKSR

来源 Source

来源生物 organism	Influenza C virus (C/Johannesburg/1/66)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	100673

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN
分子量 formula_weight	18977.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

IFGIDDLIIGVLFVAIVETGIGGYLLGSRKESGGGVTKESAEKGFEKIGNDIQILKSSINIAIEKLNDRISHDEQAIRDLTLEIENARSEALLGELGIIRALLVGNISIGLQESLWELASEITNRAGDLAVEVSPGCWIIDNNICDQSCQNFIFKFNETAPVPTIPPLDTKIDLQ

来源 Source

来源生物 organism	Influenza C virus (C/Johannesburg/1/66)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	100673

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	11

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_id	d1flca1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.3 — Hemagglutinin domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flca2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.10 — SGNH hydrolase
家族 Family family	c.23.10.2 — Esterase domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flcb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

结构域编号 domain_id	d1flcc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.3 — Hemagglutinin domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flcc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.10 — SGNH hydrolase
家族 Family family	c.23.10.2 — Esterase domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flcd_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

结构域编号 domain_id	d1flce1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.19 — Viral protein domain
超家族 Superfamily superfamily	b.19.1 — Viral protein domain
家族 Family family	b.19.1.3 — Hemagglutinin domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flce2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.10 — SGNH hydrolase
家族 Family family	c.23.10.2 — Esterase domain of haemagglutinin-esterase-fusion glycoprotein HEF1

结构域编号 domain_id	d1flcf_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.3 — Stalk segment of viral fusion proteins
超家族 Superfamily superfamily	h.3.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)
家族 Family family	h.3.1.1 — Influenza hemagglutinin (stalk)

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1flcA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1flcB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1flcC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1flcD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1flcE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	70 — Ubiquitin Ligase Nedd4; Chain: W;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1flcF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	20 — Hemagglutinin Ectodomain; Chain B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	155.400 Å
晶胞边长 b length_b	155.400 Å
晶胞边长 c length_c	414.400 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 43 2 2
空间群编号 int_tables_number	95
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	0.2230
R_work r_work	0.2230
R_free r_free	0.2670

X-RAY STRUCTURE OF THE HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN OF INFLUENZA C VIRUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1flc__assembly_1__model_1

1flc__assembly_1__model_1 | I(q)

1flc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

X-RAY STRUCTURE OF THE HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN OF INFLUENZA C VIRUS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HAEMAGGLUTININ-ESTERASE-FUSION GLYCOPROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1flc__assembly_1__model_1

1flc__assembly_1__model_1 | I(q)

1flc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)