1fmz

CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN, N14K.

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 62.1 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 3

Psophocarpus tetragonolobus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–207	突变：N14K	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.05 Å R-free 0.253
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–207	突变：N14K	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.05 Å R-free 0.253
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–207	突变：N14K	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.05 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1FMZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EYL STRUCTURE OF A RECOMBINANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 提交 2000-05-07	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；277 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1EYL STRUCTURE OF A RECOMBINANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 提交 2000-05-07	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；277 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1EYL STRUCTURE OF A RECOMBINANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 提交 2000-05-07	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；277 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.246
1FN0 STRUCTURE OF A MUTANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN, N14D. 提交 2000-08-19	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N14D	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
1FN0 STRUCTURE OF A MUTANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN, N14D. 提交 2000-08-19	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N14D	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
1FN0 STRUCTURE OF A MUTANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN, N14D. 提交 2000-08-19	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N14D	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；Ammonium sulfate, Sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
1WBC CRYSTALLIZATION AND PRELIMINARY X-RAY STUDIES OF PSOPHOCARPIN B1, A CHYMOTRYPSIN INHIBITOR FROM WINGED BEAN SEEDS 提交 1995-11-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.95 Å
1XG6 The crystal structure of the P1 mutant (Leu to Arg)of a Winged bean chymotrypsin inhibitor(Kunitz)solved at 2.15A resolution 提交 2004-09-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：L68R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.15 Å R-free 0.236
2BEA Crystal structure of Asn14 to Gly mutant of WCI 提交 2005-10-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N14G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2BEA Crystal structure of Asn14 to Gly mutant of WCI 提交 2005-10-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 25–207（183 aa）	突变：N14G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2BEB X-ray structure of Asn to Thr mutant of Winged Bean Chymotrypsin inhibitor 提交 2005-10-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N17T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；5% PEG 4000, 50 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.81 Å R-free 0.254
2BEB X-ray structure of Asn to Thr mutant of Winged Bean Chymotrypsin inhibitor 提交 2005-10-24	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 25–207（183 aa）	突变：N17T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；5% PEG 4000, 50 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.81 Å R-free 0.254
2ESU Crystal structure of Asn to Gln mutant of Winged Bean Chymotrypsin Inhibitor protein 提交 2005-10-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N17Q	NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25.4% PEG 8000, 0.17M Ammonium Sulphate, 15% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.94 Å R-free 0.238
2ESU Crystal structure of Asn to Gln mutant of Winged Bean Chymotrypsin Inhibitor protein 提交 2005-10-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N17Q	NI NICKEL (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25.4% PEG 8000, 0.17M Ammonium Sulphate, 15% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 1.94 Å R-free 0.238
2ET2 Crystal structure of an Asn to Ala mutant of Winged Bean Chymotrypsin Inhibitor protein 提交 2005-10-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N17A	NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25.5% PEG 8K, 0.17 M Ammonium Sulphate, 15% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.275
2ET2 Crystal structure of an Asn to Ala mutant of Winged Bean Chymotrypsin Inhibitor protein 提交 2005-10-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：N17A	NI NICKEL (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25.5% PEG 8K, 0.17 M Ammonium Sulphate, 15% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.275
2QYI Crystal structure of a binary complex between an engineered trypsin inhibitor and Bovine trypsin 提交 2007-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 25–207（183 aa）链 D 25–207（183 aa）	突变：L68R 突变：L68R	CA CALCIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；30% Jefamine, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.268
2WBC REFINED CRYSTAL STRUCTURE (2.3 ANGSTROM) OF A WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR AND LOCATION OF ITS SECOND REACTIVE SITE 提交 1997-11-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM 25% AMM. SULPHATE IN TRIS-HCL, 10MM NA ACETATE,400 MM NACL AT PH 5.4 AGAINST 25% AMM. SULPHATE,60MM NA ACETATE AT 4 DEGREE CENTIGRADE., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.241
3I29 Crystal structure of a binary complex between an mutant trypsin inhibitor with bovine trypsin 提交 2009-06-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–207（183 aa）	突变：F64Y, L65R	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.287
3I2A Crystal structure of a chimeric trypsin inhibitor protein STI(L)-WCI(S) 提交 2009-06-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）链 B 25–207（183 aa）	突变：Q66P, F67Y, L68R, S69I, L70R,Q66P, F67Y, L68R, S69I, L70R, Q266P, F267Y, L268R, S269I, L270R 突变：Q66P, F67Y, L68R, S69I, L70R,Q66P, F67Y, L68R, S69I, L70R, Q266P, F267Y, L268R, S269I, L270R	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG6000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.289
3I2X Crystal structure of a chimeric trypsin inhibitor having reactive site loop of ETI on the scaffold of WCI 提交 2009-06-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：Q66P, F67L, L68R, L70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.285
3I2X Crystal structure of a chimeric trypsin inhibitor having reactive site loop of ETI on the scaffold of WCI 提交 2009-06-30	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 25–207（183 aa）	突变：Q66P, F67L, L68R, L70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.285
3QYD Crystal structure of a recombinant chimeric trypsin inhibitor 提交 2011-03-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–201（177 aa）	突变：Q66R, F67L, L68R, L70A, A79R, L118Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG, 0.1M Tris, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.97 Å R-free 0.270
3QYD Crystal structure of a recombinant chimeric trypsin inhibitor 提交 2011-03-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 25–201（177 aa）	突变：Q66R, F67L, L68R, L70A, A79R, L118Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG, 0.1M Tris, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.97 Å R-free 0.270
3QYD Crystal structure of a recombinant chimeric trypsin inhibitor 提交 2011-03-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 25–201（177 aa）	突变：Q66R, F67L, L68R, L70A, A79R, L118Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG, 0.1M Tris, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.97 Å R-free 0.270
3VEQ A binary complex betwwen bovine pancreatic trypsin and a engineered mutant trypsin inhibitor 提交 2012-01-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：L668A	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.25 Å R-free 0.274
4H9W crystal structure of a METHIONINE mutant of WCI 提交 2012-09-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	突变：W91M	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.3M AMS, 5% GLYCEROL, 25% PEG 6K, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.257
4HA2 Crystal structure ofa phenyl alanine 91 mutant of WCI 提交 2012-09-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；5%PEG 6K, 10%GLYCEROL, 0.1M CITRIC ACID, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
4HA2 Crystal structure ofa phenyl alanine 91 mutant of WCI 提交 2012-09-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 25–207（183 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；5%PEG 6K, 10%GLYCEROL, 0.1M CITRIC ACID, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.282
4TLP Crystal structure of a alanine91 mutant of WCI 提交 2014-05-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–200（175 aa）片段：UNP residues 26-200	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；30% PEG6000, 0.1M Sodium Citrate	分辨率 1.90 Å R-free 0.205
4WBC 2.13 A STRUCTURE OF A KUNITZ-TYPE WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN 提交 1999-03-04	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM 25% AMM. SULPHATE IN TRIS-HCL, 10MM NA ACETATE, 400 MM NACL AT PH 5.4 AGAINST 25% AMM. SULPHATE,60MM NA ACETATE AT 4 DEG. C. CRYSTALS WERE THEN TRANSFERED TO 25% GLYCEROL (CRYOPROTECTANT) IN 25% AMM. SULPHATE, 10MM NA ACETATE BUFFER AT PH 5.4, BEFORE FLASH COOLING.	分辨率 2.14 Å R-free 0.257
4WBC 2.13 A STRUCTURE OF A KUNITZ-TYPE WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN 提交 1999-03-04	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM 25% AMM. SULPHATE IN TRIS-HCL, 10MM NA ACETATE, 400 MM NACL AT PH 5.4 AGAINST 25% AMM. SULPHATE,60MM NA ACETATE AT 4 DEG. C. CRYSTALS WERE THEN TRANSFERED TO 25% GLYCEROL (CRYOPROTECTANT) IN 25% AMM. SULPHATE, 10MM NA ACETATE BUFFER AT PH 5.4, BEFORE FLASH COOLING.	分辨率 2.14 Å R-free 0.257
4WBC 2.13 A STRUCTURE OF A KUNITZ-TYPE WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN 提交 1999-03-04	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–207（183 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.4；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM 25% AMM. SULPHATE IN TRIS-HCL, 10MM NA ACETATE, 400 MM NACL AT PH 5.4 AGAINST 25% AMM. SULPHATE,60MM NA ACETATE AT 4 DEG. C. CRYSTALS WERE THEN TRANSFERED TO 25% GLYCEROL (CRYOPROTECTANT) IN 25% AMM. SULPHATE, 10MM NA ACETATE BUFFER AT PH 5.4, BEFORE FLASH COOLING.	分辨率 2.14 Å R-free 0.257

共 19 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ICW3_PSOTE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–186； UniProt 25–207

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fmz
沉积日期 deposition_date	2000-08-19
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT WINGED BEAN CHYMOTRYPSIN INHIBITOR PROTEIN, N14K.
关键词 keywords	Beta Trefoil, HYDROLASE INHIBITOR; HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.38 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.71 Å
零角强度 I(0) i0	8146560.00
分子量 molecular_weight	20320.0 kDa
排除体积 excluded_volume	25224 Å³
包络体积 envelope_volume	29811 Å³
水化壳体积 shell_volume	15686 Å³
包络直径 envelope_diameter	57.4 Å
壳层 Rg shell_rg	21.93 Å
包络 Rg envelope_rg	16.17 Å
形状 Rg shape_rg	15.67 Å
总 Rg total_rg	16.92 Å
总原子数 total_atoms	1426
残基数 n_residues	179
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	62.1 Å
Rg (实空间) rg_real	17.25 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.41 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.1470e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.4480e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8147000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6273
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.086
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.355
角度范围 angular_range	— – 0.4600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1821000.0000
实空间数据点数 n_real_points	77
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.611; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.440; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CHYMOTRYPSIN INHIBITOR 3
分子量 formula_weight	20689.4 kDa
突变 mutation	N14K
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1633

MEFDDDLVDAEGNLVEKGGTYYLLPHIWAHGGGIETAKTGNEPCPLTVVRSPNEVSKGEPIRISSQFLSLFIPRGSLVALGFANPPSCAASPWWTVVDSPQGPAVKLSQQKLPEKDILVFKFEKVSHSNIHVYKLLYCQHDEEDVKCDQYIGIHRDRNGNRRLVVTEENPLELVLLKAKSETASSH

来源 Source

来源生物 organism	Psophocarpus tetragonolobus
通用名 common_name	winged bean
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3891
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	179

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1fmza1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamily	b.42.4 — STI-like
家族 Family family	b.42.4.1 — Kunitz (STI) inhibitors

结构域编号 domain_id	d1fmza2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1fmzA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	80 — Trefoil
拓扑 Topology topology	10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

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8. 引用文献 (4)

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晶胞边长 a length_a	60.860 Å
晶胞边长 b length_b	60.860 Å
晶胞边长 c length_c	208.430 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.050 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2100
R_work r_work	0.1930
R_free r_free	0.2530

fit	/app/data/saxs_computation/fm/1fmz/1fmz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fm/1fmz/1fmz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fm/1fmz/1fmz.dat