PROTEIN (CHORISMATE MUTASE)
Bacillus subtilis
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–127 | 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 无其他共同聚合物 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;Protein solution: 10 mM Tris-HCl, 2mM DTT, 0.125 mM EDTA, Reservoir solution: 30% PEG 400, 50 mM Tris-HCl, 50 mM Magnesium Chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K | 分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1FNJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1COM THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
未记录 | PRE PREPHENIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1COM THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 J
1–127(127 aa)
链 K
1–127(127 aa)
链 L
1–127(127 aa)
|
未记录 | PRE PREPHENIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1COM THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录 | PRE PREPHENIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1COM THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS: STRUCTURE DETERMINATION OF CHORISMATE MUTASE AND ITS COMPLEXES WITH A TRANSITION STATE ANALOG AND PREPHENATE, AND IMPLICATIONS ON THE MECHANISM OF ENZYMATIC REACTION 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
1–127(127 aa)
链 H
1–127(127 aa)
链 I
1–127(127 aa)
|
未记录 | PRE PREPHENIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1DBF CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AT 1.30 ANGSTROM 提交 1999-11-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 9 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3;298 K;PROTEIN DROP: 5 MICROLITERS PROTEIN SOLUTION, 5 MICROLITERS RESERVOIR. PROTEIN
SOLUTION: 13 MG/ML PROTEIN, 100 MM PMSF, 100 MM NACL, 50 MM TRIS PH 7.5, 1 MM
EDTA, 1 MM DTT. RESERVOIR SOLUTION: 2.2 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM
ACETATE PH 3.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.235 |
| 1FNK CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CHORISMATE MUTASE MUTANT C88K/R90S 提交 2000-08-22 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;Protein solution: 10 mM Tris-HCl, 2mM DTT, 0.125 mM EDTA, Reservoir solution: 30% PEG 400, 50 mM Tris-HCl, 50 mM magnesium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 J
1–127(127 aa)
链 K
1–127(127 aa)
链 L
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 2CHS CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
1–127(127 aa)
链 H
1–127(127 aa)
链 I
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
未记录 | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录 | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
1–127(127 aa)
链 H
1–127(127 aa)
链 I
1–127(127 aa)
|
未记录 | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2CHT CRYSTAL STRUCTURES OF THE MONOFUNCTIONAL CHORISMATE MUTASE FROM BACILLUS SUBTILIS AND ITS COMPLEX WITH A TRANSITION STATE ANALOG 提交 1994-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 J
1–127(127 aa)
链 K
1–127(127 aa)
链 L
1–127(127 aa)
|
未记录 | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 3ZO8 Wild-type chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 100 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.170 |
| 3ZO8 Wild-type chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 100 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.170 |
| 3ZOP Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 150 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.221 |
| 3ZOP Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis at 1.6 A resolution 提交 2013-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 150 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.221 |
| 3ZP4 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with a transition state analog 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER - MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY - PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 24% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 3ZP4 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with a transition state analog 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | TSA 8-HYDROXY-2-OXA-BICYCLO[3.3.1]NON-6-ENE-3,5-DICARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER - MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY - PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 24% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 3ZP7 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with chorismate and prephenate 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–127(127 aa)
链 E
1–127(127 aa)
链 F
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PRE PREPHENIC ACID × 2 ISJ (3R,4R)-3-[(1-carboxyethenyl)oxy]-4-hydroxycyclohexa-1,5-diene-1-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.218 |
| 3ZP7 Arg90Cit chorismate mutase of Bacillus subtilis in complex with chorismate and prephenate 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–127(127 aa)
链 B
1–127(127 aa)
链 C
1–127(127 aa)
|
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PRE PREPHENIC ACID × 3 ISJ (3R,4R)-3-[(1-carboxyethenyl)oxy]-4-hydroxycyclohexa-1,5-diene-1-carboxylic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6;100 MM MMT BUFFER ---MALIC ACID, MES, TRIS, IN MOLAR RATIOS OF 1:2:2, RESPECTIVELY--- PH 6.0, 125 MM CALCIUM CHLORIDE, 25% W/V PEG 1000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.218 |
共 9 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | CHMU_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–127; UniProt 1–127 |