1fw6

CRYSTAL STRUCTURE OF A TAQ MUTS-DNA-ADP TERNARY COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS

Thermus aquaticus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	同源多聚体	蛋白 2 DNA 2	5'-D(GPCPGPAPCPGPCPTPAPGPCPGPTPGPCPGPGPCPTPCPGPTPC)-3' × 1 5'-D(GPGPAPCPGPAPGPCPCPGPCPCPGPCPTPAPGPCPGPTPCP*G)-3' × 1 MAGNESIUM ION × 2 SULFATE ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MUTS_THEAQ
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–768； UniProt 1–768 作者链 B； PDB构建体 1–768； UniProt 1–768

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1fw6
沉积日期 deposition_date	2000-09-21
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A TAQ MUTS-DNA-ADP TERNARY COMPLEX
关键词 keywords	protein-DNA complex, multi-domain structure, kinked DNA, ABC ATPase, REPLICATION-DNA COMPLEX; REPLICATION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1fw6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1fw6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1fw6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.02 Å
Rg（电子密度）	40.20 Å
总 Rg	40.56 Å
原子数	12937
残基数	1527
排除体积	228080 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1fw6__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	5'-D(GPCPGPAPCPGPCPTPAPGPCPGPTPGPCPGPGPCPTPCPGPTP*C)-3'
分子量 formula_weight	7074.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	13165

GCGACGCTAGCGTGCGGCTCGTC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	5'-D(GPGPAPCPGPAPGPCPCPGPCPCPGPCPTPAPGPCPGPTPCPG)-3'
分子量 formula_weight	6779.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

GGACGAGCCGCCGCTAGCGTCG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS
分子量 formula_weight	86729.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

MEGMLKGEGPGPLPPLLQQYVELRDQYPDYLLLFQVGDFYECFGEDAERLARALGLVLTHKTSKDFTTPMAGIPLRAFEAYAERLLKMGFRLAVADQVEPAEEAEGLVRREVTQLLTPGTLLQESLLPREANYLAAIATGDGWGLAFLDVSTGEFKGTVLKSKSALYDELFRHRPAEVLLAPELLENGAFLDEFRKRFPVMLSEAPFEPEGEGPLALRRARGALLAYAQRTQGGALSLQPFRFYDPGAFMRLPEATLRALEVFEPLRGQDTLFSVLDETRTAPGRRLLQSWLRHPLLDRGPLEARLDRVEGFVREGALREGVRRLLYRLADLERLATRLELGRASPKDLGALRRSLQILPELRALLGEEVGLPDLSPLKEELEAALVEDPPLKVSEGGLIREGYDPDLDALRAAHREGVAYFLELEERERERTGIPTLKVGYNAVFGYYLEVTRPYYERVPKEYRPVQTLKDRQRYTLPEMKEKEREVYRLEALIRRREEEVFLEVRERAKRQAEALREAARILAELDVYAALAEVAVRYGYVRPRFGDRLQIRAGRHPVVERRTEFVPNDLEMAHELVLITGPNMAGKSTFLRQTALIALLAQVGSFVPAEEAHLPLFDGIYTRIGASDDLAGGKSTFMVEMEEVALILKEATENSLVLLDEVGRGTSSLDGVAIATAVAEALHERRAYTLFATHYFELTALGLPRLKNLHVAAREEAGGLVFYHQVLPGPASKSYGVEVAAMAGLPKEVVARARALLQAMAARREG

来源 Source

来源生物 organism	Thermus aquaticus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	271
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	228

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1fw6a1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.113 — DNA repair protein MutS, domain III
超家族 Superfamily superfamily	a.113.1 — DNA repair protein MutS, domain III
家族 Family family	a.113.1.1 — DNA repair protein MutS, domain III

结构域编号 domain_id	d1fw6a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d1fw6a3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.6 — DNA repair protein MutS, domain II
家族 Family family	c.55.6.1 — DNA repair protein MutS, domain II

结构域编号 domain_id	d1fw6a4
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.75 — MutS N-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.75.2 — DNA repair protein MutS, domain I
家族 Family family	d.75.2.1 — DNA repair protein MutS, domain I

结构域编号 domain_id	d1fw6b1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.113 — DNA repair protein MutS, domain III
超家族 Superfamily superfamily	a.113.1 — DNA repair protein MutS, domain III
家族 Family family	a.113.1.1 — DNA repair protein MutS, domain III

结构域编号 domain_id	d1fw6b2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d1fw6b3
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.6 — DNA repair protein MutS, domain II
家族 Family family	c.55.6.1 — DNA repair protein MutS, domain II

结构域编号 domain_id	d1fw6b4
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.75 — MutS N-terminal domain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.75.2 — DNA repair protein MutS, domain I
家族 Family family	d.75.2.1 — DNA repair protein MutS, domain I

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	1fw6A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1170 — MutS, DNA mismatch repair protein, domain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA repair protein MutS, domain I

结构域编号 domain_id	1fw6A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — MutS, connector domain

结构域编号 domain_id	1fw6A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1420 — MutS, DNA mismatch repair protein; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1fw6A04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1420 — MutS, DNA mismatch repair protein; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1fw6A05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1fw6B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1170 — MutS, DNA mismatch repair protein, domain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA repair protein MutS, domain I

结构域编号 domain_id	1fw6B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — MutS, connector domain

结构域编号 domain_id	1fw6B03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1420 — MutS, DNA mismatch repair protein; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1fw6B04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1420 — MutS, DNA mismatch repair protein; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1fw6B05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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晶胞边长 a length_a	103.717 Å
晶胞边长 b length_b	113.496 Å
晶胞边长 c length_c	160.501 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	23.170 Å
R 因子 r_factor	0.2180
R_work r_work	0.2180
R_free r_free	0.2800

CRYSTAL STRUCTURE OF A TAQ MUTS-DNA-ADP TERNARY COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1fw6__assembly_1__model_1

1fw6__assembly_1__model_1 | I(q)

1fw6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF A TAQ MUTS-DNA-ADP TERNARY COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1fw6__assembly_1__model_1

1fw6__assembly_1__model_1 | I(q)

1fw6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)