1g1i

CRYSTAL STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN FROM ROTAVIRUS NSP4

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NON-STRUCTURAL GLYCOPROTEIN NSP4

物种未注明

UniProt O92323

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 CALCIUM ION × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O92323_9REOV
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–43; UniProt 95–137 作者链 B; PDB构建体 1–43; UniProt 95–137

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1g1i
沉积日期 deposition_date2000-10-11
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN FROM ROTAVIRUS NSP4
关键词 keywordsNS28, parallel coiled-coil, homo-tetramer, metal binding site, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1g1i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1g1i__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1g1i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.14 Å
Rg(电子密度)19.94 Å
总 Rg20.48 Å
原子数1403
残基数168
排除体积25380 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1g1i__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1g1ia_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.13 — Rotavirus nonstructural proteins
家族 Family familyh.1.13.1 — NSP4 oligomerization domain
结构域编号 domain_idd1g1ib_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.1.13 — Rotavirus nonstructural proteins
家族 Family familyh.1.13.1 — NSP4 oligomerization domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1g1iA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily430
结构域编号 domain_id1g1iB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily430

7. 引用文献 (1)