1g1x

STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18, AND 16S RIBOSOMAL RNA

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （Q5SJ76） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 （Q5SLQ0）	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （Q5SJ76） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 （Q5SLQ0）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS6_THET8
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–98； UniProt 1–98 作者链 F； PDB构建体 1–98； UniProt 1–98

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

物种未注明

UniProt Q5SJ76

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （Q5SLP8） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 （Q5SLQ0）	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （Q5SLP8） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 （Q5SLQ0）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS15_THET8
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–88； UniProt 1–78 作者链 G； PDB构建体 1–88； UniProt 1–78

30S RIBOSOMAL PROTEIN S18

物种未注明

UniProt Q5SLQ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （Q5SLP8） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （Q5SJ76）	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 3 RNA 2	16S RIBOSOMAL RNA × 1 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （Q5SLP8） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （Q5SJ76）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS18_THET8
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–88； UniProt 1–87 作者链 H； PDB构建体 1–88； UniProt 1–87

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1g1x
沉积日期 deposition_date	2000-10-13
结构标题 title	STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18, AND 16S RIBOSOMAL RNA
关键词 keywords	ribosomal proteins S15, S6, S18, S30 ribosomal subunit, RNA, ribosome; RIBOSOME
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1g1x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1g1x__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1g1x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.58 Å
Rg（电子密度）	26.73 Å
总 Rg	27.16 Å
原子数	3753
残基数	316
排除体积	60251 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1g1x__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1g1x__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S RIBOSOMAL RNA
分子量 formula_weight	13576.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	D,I
原子数 atom_count	7543

AAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	16S RIBOSOMAL RNA
分子量 formula_weight	14102.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	E,J

ACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUU

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S6
分子量 formula_weight	11732.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F

MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELRIRDNVRRVMVVKSQEPFL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S15
分子量 formula_weight	10491.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G

PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYREIVEKLGLRG

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S18
分子量 formula_weight	10244.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H

MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1g1xa_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.14 — Ribosomal protein S6
家族 Family family	d.58.14.1 — Ribosomal protein S6

结构域编号 domain_id	d1g1xb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.16 — S15/NS1 RNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.16.1 — S15/NS1 RNA-binding domain
家族 Family family	a.16.1.2 — Ribosomal protein S15

结构域编号 domain_id	d1g1xc_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.8 — Ribosomal protein S18
家族 Family family	a.4.8.1 — Ribosomal protein S18

结构域编号 domain_id	d1g1xf_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.14 — Ribosomal protein S6
家族 Family family	d.58.14.1 — Ribosomal protein S6

结构域编号 domain_id	d1g1xg_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.16 — S15/NS1 RNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.16.1 — S15/NS1 RNA-binding domain
家族 Family family	a.16.1.2 — Ribosomal protein S15

结构域编号 domain_id	d1g1xh_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.8 — Ribosomal protein S18
家族 Family family	a.4.8.1 — Ribosomal protein S18

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1g1xA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

结构域编号 domain_id	1g1xB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — S15/NS1, RNA-binding

结构域编号 domain_id	1g1xC00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	640 — 30s Ribosomal Protein S18
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S18

结构域编号 domain_id	1g1xF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

结构域编号 domain_id	1g1xG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — S15/NS1, RNA-binding

结构域编号 domain_id	1g1xH00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	640 — 30s Ribosomal Protein S18
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S18

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晶胞边长 a length_a	169.500 Å
晶胞边长 b length_b	169.500 Å
晶胞边长 c length_c	113.800 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2660
R_free r_free	0.2980

STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18, AND 16S RIBOSOMAL RNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

30S RIBOSOMAL PROTEIN S18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g1x__assembly_1__model_1

1g1x__assembly_1__model_1 | I(q)

1g1x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18, AND 16S RIBOSOMAL RNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g1x__assembly_1__model_1

1g1x__assembly_1__model_1 | I(q)

1g1x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)