1g5c

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 'CAB' TYPE BETA CLASS CARBONIC ANHYDRASE FROM METHANOBACTERIUM THERMOAUTOTROPHICUM

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA-CARBONIC ANHYDRASE

Methanothermobacter thermautotrophicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 2 CALCIUM ION × 3 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 2 CALCIUM ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 2 CALCIUM ION × 2 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q50565_METTH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 B； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 C； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 D； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 E； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 F； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1g5c
沉积日期 deposition_date	2000-10-31
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE 'CAB' TYPE BETA CLASS CARBONIC ANHYDRASE FROM METHANOBACTERIUM THERMOAUTOTROPHICUM
关键词 keywords	beta carbonic anhydrase, zinc, HEPES, LYASE; LYASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1g5c__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1g5c__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1g5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.94 Å
Rg（电子密度）	19.98 Å
总 Rg	20.77 Å
原子数	2541
残基数	327
排除体积	45660 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1g5c__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1g5c__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1g5c__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BETA-CARBONIC ANHYDRASE
分子量 formula_weight	18869.7 kDa
EC 编号 ec_number	4.2.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	8010

MIIKDILRENQDFRFRDLSDLKHSPKLCIITCMDSRLIDLLERALGIGRGDAKVIKNAGNIVDDGVIRSAAVAIYALGDNEIIIVGHTDCGMARLDEDLIVSRMRELGVEEEVIENFSIDVLNPVGDEEENVIEGVKRLKSSPLIPESIGVHGLIIDINTGRLKPLYLDE

来源 Source

来源生物 organism	Methanothermobacter thermautotrophicus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	145262
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	413

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1g5ca_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

结构域编号 domain_id	d1g5cb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

结构域编号 domain_id	d1g5cc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

结构域编号 domain_id	d1g5cd_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

结构域编号 domain_id	d1g5ce_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

结构域编号 domain_id	d1g5cf_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.53 — Resolvase-like
超家族 Superfamily superfamily	c.53.2 — beta-carbonic anhydrase, cab
家族 Family family	c.53.2.1 — beta-carbonic anhydrase, cab

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1g5cA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

结构域编号 domain_id	1g5cB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

结构域编号 domain_id	1g5cC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

结构域编号 domain_id	1g5cD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

结构域编号 domain_id	1g5cE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

结构域编号 domain_id	1g5cF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1050 — Beta-carbonic Anhydrase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Carbonic anhydrase

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晶胞边长 a length_a	54.670 Å
晶胞边长 b length_b	113.210 Å
晶胞边长 c length_c	156.180 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	18.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2110
R_free r_free	0.2480

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 'CAB' TYPE BETA CLASS CARBONIC ANHYDRASE FROM METHANOBACTERIUM THERMOAUTOTROPHICUM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA-CARBONIC ANHYDRASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g5c__assembly_1__model_1

1g5c__assembly_1__model_1 | I(q)

1g5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 'CAB' TYPE BETA CLASS CARBONIC ANHYDRASE FROM METHANOBACTERIUM THERMOAUTOTROPHICUM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BETA-CARBONIC ANHYDRASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1g5c__assembly_1__model_1

1g5c__assembly_1__model_1 | I(q)

1g5c__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)