1gcc

SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX OF GCC-BOX BINDING DOMAIN OF ATERF1 AND GCC-BOX DNA, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ETHYLENE RESPONSIVE ELEMENT BINDING FACTOR 1

Arabidopsis thaliana

UniProt O80337

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*CP*GP*CP*CP*AP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*GP*GP*CP*GP*GP*CP*TP*A)-3') ; × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ERF1A_ARATH
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–63; UniProt 144–206

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1gcc
沉积日期 deposition_date1998-03-13
结构标题 titleSOLUTION NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX OF GCC-BOX BINDING DOMAIN OF ATERF1 AND GCC-BOX DNA, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
关键词 keywordsTRANSCRIPTION FACTOR, PROTEIN-DNA COMPLEX, ETHYLENE INDUCIBLE, COMPLEX (TRANSCRIPTION FACTOR-DNA), TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1gcc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1gcc__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1gcc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.75 Å
Rg(电子密度)14.00 Å
总 Rg15.06 Å
原子数1719
残基数85
排除体积15502 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1gcc__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1gcca_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.10 — DNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyd.10.1 — DNA-binding domain
家族 Family familyd.10.1.2 — GCC-box binding domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1gccA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology730 — GCC-box Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — AP2/ERF domain

7. 引用文献 (1)