1guq

STRUCTURE OF NUCLEOTIDYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH UDP-GLUCOSE

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GALACTOSE-1-PHOSPHATE URIDYLYLTRANSFERASE

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 2 FE (III) ION × 2 POTASSIUM ION × 2 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE × 2 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 2 FE (III) ION × 2 POTASSIUM ION × 2 URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAL7_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 B； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 C； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 D； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1guq
沉积日期 deposition_date	1996-10-23
结构标题 title	STRUCTURE OF NUCLEOTIDYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH UDP-GLUCOSE
关键词 keywords	TRANSFERASE, NUCLEOTIDYLTRANSFERASE, GALACTOSE METABOLISM; NUCLEOTIDYLTRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1guq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1guq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1guq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.81 Å
Rg（电子密度）	24.70 Å
总 Rg	25.55 Å
原子数	5628
残基数	691
排除体积	98979 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1guq__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1guq__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	GALACTOSE-1-PHOSPHATE URIDYLYLTRANSFERASE
分子量 formula_weight	39613.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.10
突变 mutation	H166G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	12597

MTQFNPVDHPHRRYNPLTGQWILVSPHRAKRPWQGAQETPAKQVLPAHDPDCFLCAGNVRVTGDKNPDYTGTYVFTNDFAALMSDTPDAPESHDPLMRCQSARGTSRVICFSPDHSKTLPELSVAALTEIVKTWQEQTAELGKTYPWVQVFENKGAAMGCSNPHPGGQIWANSFLPNEAEREDRLQKEYFAEQKSPMLVDYVQRELADGSRTVVETEHWLAVVPYWAAWPFETLLLPKAHVLRITDLTDAQRSDLALALKKLTSRYDNLFQCSFPYSMGWHGAPFNGEENQHWQLHAHFYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAETQRDLTAEQAAERLRAVSDIHFRESGV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE
分子量 formula_weight	566.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1359

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_id	d1guqa1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqa2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqb1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqb2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqc2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqd1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

结构域编号 domain_id	d1guqd2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.13 — HIT-like
超家族 Superfamily superfamily	d.13.1 — HIT-like
家族 Family family	d.13.1.2 — Hexose-1-phosphate uridylyltransferase

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1guqA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

结构域编号 domain_id	1guqD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	428 — HIT family, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — HIT-like

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晶胞边长 a length_a	68.400 Å
晶胞边长 b length_b	57.500 Å
晶胞边长 c length_c	188.900 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	100.13 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.800 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1740
R_free r_free	—

STRUCTURE OF NUCLEOTIDYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH UDP-GLUCOSE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GALACTOSE-1-PHOSPHATE URIDYLYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1guq__assembly_1__model_1

1guq__assembly_1__model_1 | I(q)

1guq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

STRUCTURE OF NUCLEOTIDYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH UDP-GLUCOSE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GALACTOSE-1-PHOSPHATE URIDYLYLTRANSFERASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1guq__assembly_1__model_1

1guq__assembly_1__model_1 | I(q)

1guq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)