1gxg

Non-cognate protein-protein interactions: the NMR structure of the colicin E8 inhibitor protein Im8 and its interaction with the DNase domain of colicin E9

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COLICIN E8 IMMUNITY PROTEIN

ESCHERICHIA COLI

UniProt P09881

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IMM8_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1gxg
沉积日期 deposition_date2002-04-04
结构标题 titleNon-cognate protein-protein interactions: the NMR structure of the colicin E8 inhibitor protein Im8 and its interaction with the DNase domain of colicin E9
关键词 keywordsINHIBITOR, INHIBITOR PROTEIN OF DNASE COLICIN E8, BACTERIOCIN IMMUNITY, PLASMID; INHIBITOR
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1gxg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1gxg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1gxg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)13.41 Å
Rg(电子密度)11.89 Å
总 Rg13.19 Å
原子数1316
残基数85
排除体积11836 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1gxg__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1gxga_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.28 — Acyl carrier protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.28.2 — Colicin E immunity proteins
家族 Family familya.28.2.1 — Colicin E immunity proteins

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1gxgA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Colicin E immunity protein

7. 引用文献 (1)