POLYAMINE OXIDASE
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 29–500 链 B; UniProt 29–500 | 片段:FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500 | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GZZ N-{8-[(8-{[(E)-AMINO(IMINO)METHYL]AMINO}OCTYL)AMINO]OCTYL}GUANIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 4.6;pH 4.60 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2 | 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 C; UniProt 29–500 | 片段:FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500 | ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-D-fucopyranose-(1-3)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 GZZ N-{8-[(8-{[(E)-AMINO(IMINO)METHYL]AMINO}OCTYL)AMINO]OCTYL}GUANIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 4.6;pH 4.60 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1H82 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B37 A 30 ANGSTROM U-SHAPED CATALYTIC TUNNEL IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE 提交 1998-12-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.6
|
分辨率 1.90 Å |
| 1H81 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN THE REDUCED STATE 提交 2001-01-24 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.235 |
| 1H81 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN THE REDUCED STATE 提交 2001-01-24 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN RESIDUES 29-500
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.235 |
| 1H83 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH 1,8-DIAMINOOCTANE 提交 2001-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 DIA OCTANE 1,8-DIAMINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 1H83 STRUCTURE OF POLYAMINE OXIDASE IN COMPLEX WITH 1,8-DIAMINOOCTANE 提交 2001-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 DIA OCTANE 1,8-DIAMINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 1H84 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 4.6 提交 2001-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
链 B
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 1H84 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 4.6 提交 2001-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
29–500(472 aa)
片段:FAD-BINDING DOMAIN
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;pH 4.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 1H86 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 7.0 提交 2001-01-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
链 B
29–500(472 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 1H86 COVALENT ADDUCT BETWEEN POLYAMINE OXIDASE AND N1ethylN11((cycloheptyl)methyl)4,8diazaundecane at pH 7.0 提交 2001-01-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
29–500(472 aa)
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NBA 3-[(3-{[3-(METHYLAMINO)PROPYL]AMINO}PROPYL)AMINO]PROPANE-1,1-DIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.00
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.223 |
| 3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ACT ACETATE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.223 |
| 3KPF X-ray structure of the mutant Lys300Met of polyamine oxidase from Zea mays 提交 2009-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M 突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.223 |
| 3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPM SPERMINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.219 |
| 3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.219 |
| 3KU9 X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermine 提交 2009-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M 突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPM SPERMINE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.219 |
| 3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPD SPERMIDINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.216 |
| 3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.216 |
| 3L1R X-ray structure of the mutant lys300met of polyamine oxidase from zea mays in complex with spermidine 提交 2009-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
29–500(472 aa)
链 B
29–500(472 aa)
|
突变:K300M 突变:K300M | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SPD SPERMIDINE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;50% SATURATED AMMONIUM SULFATE
SOLUTION, 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.216 |
共 8 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | PAO_MAIZE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–472; UniProt 29–500 作者链 B; PDB构建体 1–472; UniProt 29–500 作者链 C; PDB构建体 1–472; UniProt 29–500 |