1ha7

STRUCTURE OF A LIGHT-HARVESTING PHYCOBILIPROTEIN, C-PHYCOCYANIN FROM SPIRULINA PLATENSIS AT 2.2A RESOLUTION

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN × 6 （P72508） PHYCOCYANOBILIN × 18 water × 12	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN × 6 （P72508） PHYCOCYANOBILIN × 18 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHCA_SPIPL
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 C； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 E； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 G； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 I； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 K； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 M； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 O； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 Q； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 S； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 U； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162 作者链 W； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P72508

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN × 6 （P72509） PHYCOCYANOBILIN × 18 water × 12	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN × 6 （P72509） PHYCOCYANOBILIN × 18 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHCB_SPIPL
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 D； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 F； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 H； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 J； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 L； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 N； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 P； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 R； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 T； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 V； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 X； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ha7
沉积日期 deposition_date	2001-03-29
结构标题 title	STRUCTURE OF A LIGHT-HARVESTING PHYCOBILIPROTEIN, C-PHYCOCYANIN FROM SPIRULINA PLATENSIS AT 2.2A RESOLUTION
关键词 keywords	PHOTOSYNTHESIS, CYANOBACTERIA, LIGHT-HARVESTING PROTEIN, PIGMENT PROTEIN, PHYCOCYANOBILIN, CHROMOPHORE; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ha7__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ha7__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ha7__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.39 Å
Rg（电子密度）	40.62 Å
总 Rg	41.02 Å
原子数	15786
残基数	1998
排除体积	281170 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ha7__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1ha7__assembly_2__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN
分子量 formula_weight	17618.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W
原子数 atom_count	33855

MKTPLTEAVSIADSQGRFLSSTEIQVAFGRFRQAKAGLEAAKALTSKADSLISGAAQAVYNKFPYTTQMQGPNYAADQRGKDKCARDIGYYLRMVTYCLIAGGTGPMDEYLIAGIDEINRTFELSPSWYIEALKYIKANHGLSGDAATEANSYLDYAINALS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN
分子量 formula_weight	18122.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X

MFDAFTKVVSQADTRGEMLSTAQIDALSQMVAESNKRLDAVNRITSNASTIVSNAARSLFAEQPQLIAPGGNAYTSRRMAACLRDMEIILRYVTYAVFAGDASVLEDRCLNGLRETYLALGTPGSSVAVGVGKMKEAALAIVNDPAGITPGDCSALASEIASYFDRACAAVS

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	PHYCOCYANOBILIN
分子量 formula_weight	588.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	36

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2283

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_id	d1ha7a_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7d_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7e_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7f_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7g_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7h_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7i_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7j_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7k_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7l_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7m_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7n_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7o_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7p_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7q_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7r_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7s_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7t_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7u_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7v_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7w_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

结构域编号 domain_id	d1ha7x_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamily	a.1.1 — Globin-like
家族 Family family	a.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id	1ha7A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7E00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7G00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7H00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7I00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7J00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7K00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7L00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7M00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7N00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7O00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7P00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7Q00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7R00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7S00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7T00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7U00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7V00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7W00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

结构域编号 domain_id	1ha7X00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phycocyanins

▶

晶胞边长 a length_a	107.200 Å
晶胞边长 b length_b	115.400 Å
晶胞边长 c length_c	183.040 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.21 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	22.900 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2380

STRUCTURE OF A LIGHT-HARVESTING PHYCOBILIPROTEIN, C-PHYCOCYANIN FROM SPIRULINA PLATENSIS AT 2.2A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ha7__assembly_2__model_1

1ha7__assembly_2__model_1 | I(q)

1ha7__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (3)

STRUCTURE OF A LIGHT-HARVESTING PHYCOBILIPROTEIN, C-PHYCOCYANIN FROM SPIRULINA PLATENSIS AT 2.2A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

C-PHYCOCYANIN BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ha7__assembly_2__model_1

1ha7__assembly_2__model_1 | I(q)

1ha7__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 48 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

CATH v4.4 (24 domains)

7. 引用文献 (3)