VIRAL MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-II
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 24–94 | 片段：RESIDUES 1-71 | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5；303 K；压力 1 | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1HFG | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CM9 CRYSTAL STRUCTURE OF VIRAL MACROPHAGE INFLAMMATORY PROTEIN-II 提交 1999-05-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–94（74 aa）
链 B
21–94（74 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.275 |
| 1HFF NMR solution structures of the vMIP-II 1-10 peptide from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus. 提交 2000-12-01 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–33（10 aa）
片段：RESIDUES 1-10
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未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；281 K；离子强度（mmCIF原始值）20MM SODIUM ACETATE；压力 1
NMR样品组成
20MM SODIUM ACETATE, 1-2MM PEPTIDE, 1MM SODIUM AZIDE, 1MM DSS
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分辨率未提供 |
| 1HFN NMR solution structures of vMIP-II 1-71 from Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus. 提交 2000-12-07 | 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–94（71 aa）
片段：RESIDUES 1-71
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未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5；303 K；压力 1
NMR样品组成
1MM DSS, 1MM NAN3, 20MM SODIUM ACETATE
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分辨率未提供 |
| 1HHV SOLUTION STRUCTURE OF VIRUS CHEMOKINE VMIP-II 提交 1998-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
21–94（74 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 3.25；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM
NMR样品组成
90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1VMP STRUCTURE OF THE ANTI-HIV CHEMOKINE VMIP-II 提交 1999-03-25 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–94（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 1
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分辨率未提供 |
| 2FHT Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-27 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–94（71 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；0.1 M sodium citrate, 11% (w/v) PEG 4000, 11%(w/v) 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.331 |
| 2FJ2 Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
24–94（71 aa）
链 B
24–94（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；298 K；100mM Sodium Citrate, 11% PEG 4000, 11% 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
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分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 2FJ2 Crystal Structure of Viral Macrophage Inflammatory Protein-II 提交 2005-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
24–94（71 aa）
链 D
24–94（71 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；298 K；100mM Sodium Citrate, 11% PEG 4000, 11% 2-propanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
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分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 4RWS Crystal structure of CXCR4 and viral chemokine antagonist vMIP-II complex (PSI Community Target) 提交 2014-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
24–94（71 aa）
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突变：W5C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；100 mM sodium citrate pH 5.5, 28% PEG 400, 120 mM ammonium phosphate dibasic, 2-6% polypropylene P400, Lipidic cubic phase, temperature 293K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
共 8 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | VMI2_KSHV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–71； UniProt 24–94 |
