1hh2

Crystal structure of NusA from Thermotoga maritima

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

N UTILIZATION SUBSTANCE PROTEIN A

THERMOTOGA MARITIMA

UniProt Q9X298

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9X298
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–344; UniProt 1–344

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1hh2
沉积日期 deposition_date2000-12-18
结构标题 titleCrystal structure of NusA from Thermotoga maritima
关键词 keywordsTRANSCRIPTION REGULATION, TERMINATION; TRANSCRIPTION REGULATION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1hh2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1hh2__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1hh2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)38.61 Å
Rg(电子密度)38.44 Å
总 Rg38.80 Å
原子数5334
残基数688
排除体积96976 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1hh2__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1hh2p1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamilyb.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family familyb.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like
结构域编号 domain_idd1hh2p2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.52 — Alpha-lytic protease prodomain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.52.3 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
家族 Family familyd.52.3.1 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
结构域编号 domain_idd1hh2p3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.52 — Alpha-lytic protease prodomain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.52.3 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
家族 Family familyd.52.3.1 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
结构域编号 domain_idd1hh2p4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.202 — Transcription factor NusA, N-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyd.202.1 — Transcription factor NusA, N-terminal domain
家族 Family familyd.202.1.1 — Transcription factor NusA, N-terminal domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1hh2P01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1480 — N Utilization Substance Protein A; Chain:P; domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — NusA, N-terminal domain
结构域编号 domain_id1hh2P02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id1hh2P03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — K homology (KH) domain
结构域编号 domain_id1hh2P04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — K homology (KH) domain

7. 引用文献 (1)