CYTOCHROME B5
BOS TAURUS
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–104 | 片段:HEME BINDING DOMAIN, RESIDUES 1-104 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 7;300 K | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1HKO | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CYO BOVINE CYTOCHROME B(5) 提交 1994-08-03 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
5–97(93 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å |
| 1EHB CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT OF CYTOCHROME B5 提交 2000-02-20 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
8–89(82 aa)
片段:TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;phosphate buffer, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 1ES1 CRYSTAL STRUCTURE OF VAL61HIS MUTANT OF TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT OF CYTOCHROME B5 提交 2000-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
8–89(82 aa)
片段:TRYPSIN-SOLUBILIZED FRAGMENT
|
突变:VAL61HIS | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 1F03 SOLUTION STRUCTURE OF OXIDIZED BOVINE MICROSOMAL CYTOCHROME B5 MUTANT (E44A, E48A, E56A, D60A) AND ITS INTERACTION WITH CYTOCHROME C 提交 2000-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
|
突变:E44A, E48A, E56A, D60A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM;压力 1
NMR样品组成
6 mM cytochrome b5 mutant 1H | 10 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
6 mM cytochrome b5 mutant 1H | 10 mM phosphate buffer, D2O
|
分辨率未提供 |
| 1F04 SOLUTION STRUCTURE OF OXIDIZED BOVINE MICROSOMAL CYTOCHROME B5 MUTANT (E44A, E48A, E56A, D60A) AND ITS INTERACTION WITH CYTOCHROME C 提交 2000-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
|
突变:E44A, E48A, E56A, D60A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM;压力 1
NMR样品组成
6 mM cytochrome b5 mutant 1H | 10 mM phosphate buffer , 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
6 mM cytochrome b5 mutant 1H | 10 mM phosphate buffer, D2O
|
分辨率未提供 |
| 1I5U SOLUTION STRUCTURE OF CYTOCHROME B5 TRIPLE MUTANT (E48A/E56A/D60A) 提交 2001-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
8–89(82 aa)
片段:SOLUBLE DOMAIN (RESIDUES 8-89)
|
突变:E48A/E56A/D60A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;压力 1
NMR测量条件
pH 7;303 K;压力 1
NMR测量条件
pH 7;303 K;压力 1
NMR测量条件
pH 7;303 K;压力 1
NMR样品组成
4mM cytochrome b5 triple mutant(E48A/E56A/D60A) | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1J0Q Solution Structure of Oxidized Bovine Microsomal Cytochrome b5 mutant V61H 提交 2002-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:Trypsin-Solubilized Fragment
|
突变:V61H | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;压力 ambient
NMR样品组成
2.9mM enzyme, pH 7.0, 25mM phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1LQX Crystal structure of V45E mutant of cytochrome b5 提交 2002-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5
|
突变:V45E | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1LR6 Crystal structure of V45Y mutant of cytochrome b5 提交 2002-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5
|
突变:V45Y | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 1M20 Crystal Structure of F35Y Mutant of Trypsin-solubilized Fragment of Cytochrome b5 提交 2002-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F35Y | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |
| 1M2I Crystal structure of E44A/E56A mutant of cytochrome b5 提交 2002-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5
|
突变:E44A, E56A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;PHOSPHATE BUFFER, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1M2M Crystal structure of E44A/E48A/E56A/D60A mutant of cytochrome b5 提交 2002-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment of cytochrome b5
|
突变:E44A, E48A, E56A, D60A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;PHOSPHATE BUFFER, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 1M59 Crystal Structure of P40V Mutant of Trypsin-solubilized Fragment of Cytochrome b5 提交 2002-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:P40V | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;phosphate buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 1NX7 Solution Structure of Oxidized Bovine Microsomal Cytochrome B5 提交 2003-02-10 | 构建体不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:RESIDUES 3-84
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;300 K;离子强度(mmCIF原始值)25mM Phosphate buffer;压力 1
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)25mM Phosphate buffer;压力 1
NMR样品组成
3.0mM | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3.0mM | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1SH4 Solution structure of oxidized bovine microsomal cytochrome B5 Mutant V45H 提交 2004-02-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:residues 3-84
|
突变:V45H | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)25mM PHOSPHATE BUFFER;压力 1
NMR样品组成
3.0mM | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3.0mM | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9M Crystal structure of F58W mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
7–88(82 aa)
片段:trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58W | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 1U9U Crystal structure of F58Y mutant of cytochrome b5 提交 2004-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
7–88(82 aa)
片段:Trypsin-solubilized fragment
|
突变:F58Y | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;phosphate buffer, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.215 |
| 3OZZ Structure of a cytochrome b5 core-swap mutant 提交 2010-09-27 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
8–89(82 aa)
片段:N-TERMINAL HEME-BINDING DOMAIN (unp residues 8-89)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;277 K;30% PEG8000, 0.2M MgAc, 0.1M Pipes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.229 |
| 4HIN 2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L) 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
8–89(82 aa)
|
突变:S71L | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 4HIN 2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L) 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
8–89(82 aa)
|
突变:S71L | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 4HIN 2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L) 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
8–89(82 aa)
|
突变:S71L | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 4HIN 2.4A Resolution Structure of Bovine Cytochrome b5 (S71L) 提交 2012-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
8–89(82 aa)
|
突变:S71L | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris, 200 mM MgCl2, 10 mM CuCl2, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
共 19 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | CYB5_BOVIN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 |