GLUCOSE PERMEASE
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 391–476 | 片段:DOMAIN IIB | 无其他共同聚合物 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1IBA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1O2F COMPLEX OF ENZYME IIAGLC AND IIBGLC PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR FROM ESCHERICHIA COLI NMR, RESTRAINED REGULARIZED MEAN STRUCTURE 提交 2003-03-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
387–476(90 aa)
|
未记录 | PO3 PHOSPHITE ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;308 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM SODIUM PHOSPHATE
|
分辨率未提供 |
| 3BP3 Crystal structure of EIIB 提交 2007-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
396–477(82 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å R-free 0.241 |
| 3BP3 Crystal structure of EIIB 提交 2007-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
396–477(82 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å R-free 0.241 |
| 3BP8 Crystal structure of Mlc/EIIB complex 提交 2007-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
401–475(75 aa)
片段:UNP residues 401-475
链 D
401–475(75 aa)
片段:UNP residues 401-475
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 3 ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;6% PEG 6K, 0.1M MgCl2, 0.1M sodium acetate, pH5.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.301 |
| 3BP8 Crystal structure of Mlc/EIIB complex 提交 2007-12-18 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
401–475(75 aa)
片段:UNP residues 401-475
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;6% PEG 6K, 0.1M MgCl2, 0.1M sodium acetate, pH5.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.301 |
| 3BP8 Crystal structure of Mlc/EIIB complex 提交 2007-12-18 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
401–475(75 aa)
片段:UNP residues 401-475
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;6% PEG 6K, 0.1M MgCl2, 0.1M sodium acetate, pH5.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.301 |
| 8QSR Cryo-EM structure of the glucose-specific PTS transporter IICB from E. coli in the inward-facing conformation 提交 2023-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–477(477 aa)
链 B
1–477(477 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å |
| 8QST Cryo-EM structure of the glucose-specific PTS transporter IICB from E. coli in the inward- and outward-facing conformation 提交 2023-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–477(477 aa)
链 B
1–477(477 aa)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 9HNP Cryo-EM structure of the glucose-specific PTS transporter IICB from E. coli in an intermediate state 提交 2024-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–477(477 aa)
链 B
1–477(477 aa)
|
未记录 | LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.53 Å |
共 6 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PTGCB_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 5–90; UniProt 391–476 |