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1if0

PSEUDO-ATOMIC MODEL OF BACTERIOPHAGE HK97 PROCAPSID (PROHEAD II)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (MAJOR CAPSID PROTEIN GP5)

Enterobacteria phage HK97

UniProt P49861

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 420 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 7 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 35 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 42 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 7 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1if0 1if0 1if0 1if0 1if0 1ohg 1ohg 1ohg 1ohg 1ohg 1ohg 2frp

共 64 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COAT_BPHK7
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 B； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 C； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 D； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 E； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 F； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383 作者链 G； PDB构建体 1–256； UniProt 128–383

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1if0
沉积日期 deposition_date2001-04-11
结构标题 titlePSEUDO-ATOMIC MODEL OF BACTERIOPHAGE HK97 PROCAPSID (PROHEAD II)
关键词 keywordsBacteriophage, Virus, Capsid, cryoEM, Pseudo-atomic model., Icosahedral virus; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1if0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1if0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 109 1010 1011 1012 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1if0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）236.90 Å
总 Rg236.90 Å
原子数0
残基数0
排除体积14462000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1if0__assembly_1__model_1 420-MERIC （420） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1if0__assembly_2__model_1 heptameric （7） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1if0__assembly_3__model_1 35-meric （35） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1if0__assembly_4__model_1 42-meric （42） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1if0__assembly_5__model_1 heptameric （7） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (7 domains)

结构域编号 domain_idd1if0a_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0b_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0c_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0d_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0e_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0f_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
结构域编号 domain_idd1if0g_
类 Class classi — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold foldi.14 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
超家族 Superfamily superfamilyi.14.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
家族 Family familyi.14.1.1 — Bacteriophage HK97 procapsid (prohead II)
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7. 引用文献 (3)