1j1e

Crystal structure of the 52kDa domain of human cardiac troponin in the Ca2+ saturated form

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Troponin C

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin T × 1 （P45379） Troponin I × 1 （P19429） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin T × 1 （P45379） Troponin I × 1 （P19429） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 D； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Troponin T

Homo sapiens

UniProt P45379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin C × 1 （P63316） Troponin I × 1 （P19429） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin C × 1 （P63316） Troponin I × 1 （P19429） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNT2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–106； UniProt 183–288 作者链 E； PDB构建体 1–106； UniProt 183–288

Troponin I

Homo sapiens

UniProt P19429

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin C × 1 （P63316） Troponin T × 1 （P45379） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Troponin C × 1 （P63316） Troponin T × 1 （P45379） CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–180； UniProt 30–209 作者链 F； PDB构建体 1–180； UniProt 30–209

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1j1e
沉积日期 deposition_date	2002-12-03
结构标题 title	Crystal structure of the 52kDa domain of human cardiac troponin in the Ca2+ saturated form
关键词 keywords	Thin filament, muscle regulation, Ca2+ binding protein, EF-hand, coiled-coil, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1j1e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1j1e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1j1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.97 Å
Rg（电子密度）	31.40 Å
总 Rg	31.63 Å
原子数	2804
残基数	345
排除体积	49916 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1j1e__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1j1e__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Troponin C
分子量 formula_weight	18401.4 kDa
突变 mutation	C35S, C84S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	5860

MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGSISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRSMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLEELKIMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGVE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Troponin T
分子量 formula_weight	12842.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

HFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQTIYNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Troponin I
分子量 formula_weight	20746.0 kDa
突变 mutation	T31M, C80A, C97A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

MEPHAKKKSKISASRKLQLKTLLLQIAKQELEREAEERRGEKGRALSTRAQPLELAGLGFAELQDLARQLHARVDKVDEERYDIEAKVTKNITEIADLTQKIFDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALLGARAKESLDLRAHLKQVKKEDTEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFES

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1j1ea_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d1j1eb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.1 — Troponin T

结构域编号 domain_id	d1j1ec_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.2 — Troponin I

结构域编号 domain_id	d1j1ed_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d1j1ee_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.1 — Troponin T

结构域编号 domain_id	d1j1ef_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.1 — Parallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.1.25 — Troponin coil-coiled subunits
家族 Family family	h.1.25.2 — Troponin I

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	1j1eA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1j1eA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1j1eB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

结构域编号 domain_id	1j1eC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

结构域编号 domain_id	1j1eD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1j1eD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	1j1eE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

结构域编号 domain_id	1j1eF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Troponin complex, TnI/TnT subunit

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晶胞边长 a length_a	48.299 Å
晶胞边长 b length_b	169.506 Å
晶胞边长 c length_c	68.538 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	102.38 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2510
R_free r_free	0.3080

Crystal structure of the 52kDa domain of human cardiac troponin in the Ca2+ saturated form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Troponin C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin T

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1j1e__assembly_1__model_1

1j1e__assembly_1__model_1 | I(q)

1j1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (3)

Crystal structure of the 52kDa domain of human cardiac troponin in the Ca2+ saturated form

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Troponin C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin T

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1j1e__assembly_1__model_1

1j1e__assembly_1__model_1 | I(q)

1j1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (3)