Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | 5'-D(*AP*AP*GP*GP*(6MA)P*TP*CP*CP*AP*A)-3' × 1 5'-D(*TP*TP*GP*GP*AP*GP*CP*CP*TP*T)-3' × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | SEQA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–115； UniProt 71–181 |
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| 条目编号 entry_id | 1j3e |
| 沉积日期 deposition_date | 2003-01-24 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of the E.coli SeqA protein complexed with N6-methyladenine- guanine mismatch DNA |
| 关键词 keywords | ;Protein-DNA complex, Recognition of hemimethylated DNA, mismatched DNA, replication, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, Structural Genomics, REPLICATION-DNA COMPLEX ;; REPLICATION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.69 Å |
| Rg（电子密度） | 15.70 Å |
| 总 Rg | 16.61 Å |
| 原子数 | 1315 |
| 残基数 | 134 |
| 排除体积 | 22160 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d1j3ea1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.228 — Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.228.1 — Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain |
| 家族 Family family | d.228.1.1 — Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | d1j3ea2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 1j3eA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1380 — Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain |